More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2739 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 364 aa  735    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  34.19 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  34.2 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  34.37 
 
 		 396 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  32.42 
 
 		 356 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  35.16 
 
 		 436 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  34.87 
 
 		 385 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  31.87 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  31.87 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  34.58 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  34.36 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  34.13 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  34.58 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  33.14 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  34.58 
 
 		 386 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  34.58 
 
 		 386 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  34.58 
 
 		 386 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  34.58 
 
 		 386 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  34.58 
 
 		 386 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  35.28 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  31.59 
 
 		 356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  34.77 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  34.65 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  33.81 
 
 		 376 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  34.1 
 
 		 376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  34.29 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  32.5 
 
 		 388 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  33.04 
 
 		 383 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  33.04 
 
 		 383 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  34.38 
 
 		 384 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  32.5 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  35.87 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  32.1 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  34.65 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  33.04 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  32.11 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  44.35 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  32.56 
 
 		 395 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  34.01 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  32.37 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  35.29 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  35.03 
 
 		 376 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  32.56 
 
 		 395 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  32.46 
 
 		 411 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  33.59 
 
 		 383 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  31.85 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  34.52 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  33.73 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  33.33 
 
 		 383 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  32.76 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  33.33 
 
 		 408 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  34.33 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  33.33 
 
 		 383 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  33.7 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  32.02 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  31.27 
 
 		 471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  33.94 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  34.1 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  33.94 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  34.25 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  33.94 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  33.94 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  34.27 
 
 		 385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  35.67 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  32.41 
 
 		 381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  34.82 
 
 		 347 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  31.73 
 
 		 395 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  40.81 
 
 		 405 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  32.33 
 
 		 403 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  33.94 
 
 		 384 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  32.33 
 
 		 403 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  34.71 
 
 		 391 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  32.02 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  33.05 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  33.94 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  32.02 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  32.57 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  33.05 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  34.73 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  31.47 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  33.94 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  33.43 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  40.99 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  33.05 
 
 		 386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3000  porin Gram-negative type  35.98 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  32.08 
 
 		 398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  40.99 
 
 		 418 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  33.94 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  32.31 
 
 		 381 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  32.69 
 
 		 390 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  34.19 
 
 		 354 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  30.65 
 
 		 386 aa  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  33.73 
 
 		 385 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  31.91 
 
 		 386 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  33.44 
 
 		 359 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  31.25 
 
 		 380 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  34.33 
 
 		 390 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  33.15 
 
 		 338 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  37.4 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  31.91 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>