More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1354 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1354  porin  100 
 
 		 352 aa  701    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2502  putative outer membrane protein (porin)  49.58 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506227  normal  0.418434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2108  putative outer membrane protein (porin)  49.58 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  44.93 
 
 		 367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0359  putative porin protein  44.67 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0373439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1592  putative outer membrane protein (porin)  45.11 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  34.06 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  34.14 
 
 		 355 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  33.96 
 
 		 351 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  33.88 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1601  porin  33.07 
 
 		 374 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32825  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  33 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1582  porin  33.33 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  32.17 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  32.17 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  33.77 
 
 		 354 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4837  outer membrane protein, (porin)  31.42 
 
 		 374 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  34.06 
 
 		 367 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  32.44 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  33 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  32.43 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  33.78 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  32.29 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  32.55 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  34.53 
 
 		 402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  33.16 
 
 		 375 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  31.25 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  33.71 
 
 		 353 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0274  OmpC family outer membrane porin  31.35 
 
 		 350 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000878136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  33.16 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  33.08 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  33.16 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  34.96 
 
 		 367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  33.06 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  32.46 
 
 		 362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1434  putative porin protein  31.32 
 
 		 379 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3095  putative outer membrane porin  31.32 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2036  putative outer membrane porin  31.32 
 
 		 375 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2327  putative outer membrane porin  31.32 
 
 		 376 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1060  putative outer membrane porin  31.32 
 
 		 376 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1346  putative outer membrane porin  31.32 
 
 		 376 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.80313  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  30.43 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  30.43 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  30.39 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5712  porin  30.51 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  33.68 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  33.52 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  33.52 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  30.43 
 
 		 383 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  32.29 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  32.28 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  34.66 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  32.28 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  30.98 
 
 		 376 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  31.59 
 
 		 388 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  34.53 
 
 		 363 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  34.53 
 
 		 363 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  34.53 
 
 		 363 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  31.32 
 
 		 392 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  31.32 
 
 		 392 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  31.69 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6355  porin  29.89 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  30.52 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  32.51 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  31.58 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  31.41 
 
 		 379 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  33.89 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  31.32 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  30.23 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  34.47 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  31.76 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  33.63 
 
 		 374 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  32.5 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  31.13 
 
 		 355 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  37.97 
 
 		 368 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  32.34 
 
 		 414 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  31.75 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  29.86 
 
 		 363 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  30.95 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  31.92 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  33.08 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  33.04 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  29.31 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  33.08 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  33.05 
 
 		 363 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  30 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  29.77 
 
 		 359 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  29.77 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  29.77 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  32.66 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  29.04 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  32.66 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2974  outer membrane porin  29.04 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.598026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  32.66 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  29.04 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  30.33 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  32.45 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  32.66 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  32.66 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>