More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A3095 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2327  putative outer membrane porin  100 
 
 		 376 aa  746    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2036  putative outer membrane porin  100 
 
 		 375 aa  744    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1434  putative porin protein  100 
 
 		 379 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1346  putative outer membrane porin  100 
 
 		 376 aa  746    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.80313  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1060  putative outer membrane porin  100 
 
 		 376 aa  746    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3095  putative outer membrane porin  100 
 
 		 391 aa  780    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1601  porin  74.02 
 
 		 374 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32825  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4837  outer membrane protein, (porin)  73.31 
 
 		 374 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1582  porin  74.44 
 
 		 374 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6355  porin  63.73 
 
 		 398 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  34.3 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  34.56 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  34.25 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  34.74 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  33.96 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  33.96 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  33.69 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  33.42 
 
 		 361 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2457  porin  34.73 
 
 		 359 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0201668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5613  porin  32.6 
 
 		 363 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000212183  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5977  porin  32.6 
 
 		 363 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297374  decreased coverage  0.000158153 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7310  outer membrane protein (porin)  31.93 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  0.523788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  33.06 
 
 		 359 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  32.36 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7462  outer membrane protein (porin)  31.28 
 
 		 360 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00141122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0274  OmpC family outer membrane porin  31.86 
 
 		 350 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000878136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2108  putative outer membrane protein (porin)  33.77 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2502  putative outer membrane protein (porin)  33.77 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506227  normal  0.418434 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6767  outer membrane protein (porin)-like  29.71 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0380133  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6483  porin  32.8 
 
 		 351 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6718  porin  32.8 
 
 		 351 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.457172 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.35 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0359  putative porin protein  30.87 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0373439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1354  porin  31.44 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786529 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0416  outer membrane protein (porin)  31.08 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.441779  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  30.17 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  30.17 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  30.17 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  30.17 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  30.17 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  30.17 
 
 		 449 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5230  outer membrane protein, (porin)  29.53 
 
 		 348 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  28.53 
 
 		 358 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5649  outer membrane protein (porin)  30.97 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  32.44 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5210  outer membrane protein (porin)  30.97 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00719172  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  30.06 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  30.06 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1592  putative outer membrane protein (porin)  28.49 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  29.35 
 
 		 354 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  29.89 
 
 		 358 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5128  outer membrane protein (porin)  31.62 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  29.39 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  29.97 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  29.65 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  28.85 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  30.38 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4595  outer membrane protein (porin)  31.36 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  30.38 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  28.43 
 
 		 359 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  29.02 
 
 		 357 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  31.05 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  27.54 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  29.24 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0843  OmpC family outer membrane porin  29.98 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0712597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  28.61 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3196  outer membrane protein (porin)  30.21 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  29.29 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  30 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2607  OmpC family outer membrane porin  31.63 
 
 		 363 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.782547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  29.21 
 
 		 364 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  30.29 
 
 		 363 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  28.91 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  30.28 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  28.88 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  28.89 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  30.81 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  30.81 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  29.62 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  30.02 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  30.27 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  30.54 
 
 		 363 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  28.82 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6216  porin  27.25 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6806  OmpC family outer membrane porin  31.31 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  29.5 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  28.64 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  30.14 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  28.64 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  28.32 
 
 		 371 aa  99.8  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  30.53 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  30.53 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  30.53 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  30.53 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  30.53 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  28.75 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  29.72 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  30.53 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  29.59 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1917  porin  28.29 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>