More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4106 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  94.71 
 
 		 359 aa  697    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  94.43 
 
 		 359 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  94.99 
 
 		 359 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  99.44 
 
 		 359 aa  723    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  92.42 
 
 		 359 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  100 
 
 		 359 aa  726    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  94.43 
 
 		 359 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  73.2 
 
 		 362 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  73.2 
 
 		 383 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  73.2 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  73.2 
 
 		 362 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  73.2 
 
 		 383 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  73.2 
 
 		 432 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  72.46 
 
 		 496 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1303  outer membrane porin  72.89 
 
 		 362 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  68.16 
 
 		 357 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  67.6 
 
 		 357 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  67.6 
 
 		 357 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  51.98 
 
 		 357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0260  outer membrane protein (porin)  45.08 
 
 		 373 aa  288  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4632  porin Gram-negative type  43.77 
 
 		 368 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.656997 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  39.5 
 
 		 366 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  39.5 
 
 		 366 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2717  OmpC family outer membrane porin  38.44 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000457721  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2803  OmpC family outer membrane porin  39.44 
 
 		 360 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6034  porin  37.26 
 
 		 382 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4894  porin  35.44 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  38.9 
 
 		 378 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  37.7 
 
 		 380 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  37.7 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  37.98 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  37.24 
 
 		 380 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  36.71 
 
 		 358 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  41.88 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  37.36 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  35.42 
 
 		 380 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  35.42 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  35.22 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1848  putative outer membrane porin  35.22 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0156948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2322  outer membrane porin protein  35.22 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  35.22 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  36 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  41.6 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  41.6 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1102  outer membrane porin  35.62 
 
 		 358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  36.25 
 
 		 383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  41.6 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  36.1 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  35.2 
 
 		 392 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  33.83 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  35 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  34.69 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2000  porin Gram-negative type  35.57 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  33.69 
 
 		 367 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  34.34 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  40.48 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  37.6 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  40.9 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  35.1 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  37.24 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  34.43 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  35.53 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2524  OmpC family outer membrane porin  36.49 
 
 		 362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510501  normal  0.104939 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  37.15 
 
 		 362 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  37.15 
 
 		 362 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  37.15 
 
 		 362 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  35.75 
 
 		 396 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  35.2 
 
 		 383 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  34.44 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  35.28 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  34.85 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  35.01 
 
 		 380 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  34.11 
 
 		 381 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  32.66 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  33.76 
 
 		 381 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  35.91 
 
 		 409 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  34.04 
 
 		 380 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  33.68 
 
 		 384 aa  169  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  34.11 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  35.16 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  37.08 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  34.88 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  34.43 
 
 		 384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  32.9 
 
 		 383 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  35.14 
 
 		 375 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  33.42 
 
 		 384 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  35.14 
 
 		 375 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  35.28 
 
 		 394 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  33.42 
 
 		 384 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  34.01 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  34.51 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  35.4 
 
 		 381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  34.87 
 
 		 383 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  32.64 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  33.16 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  36.13 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  33.92 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  36.46 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  33.16 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  33.16 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>