More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0172 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  96.36 
 
 		 357 aa  708    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 357 aa  727    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  80.11 
 
 		 357 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  70.81 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  70.81 
 
 		 432 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  70.81 
 
 		 383 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  70.81 
 
 		 362 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  70.81 
 
 		 362 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  70.81 
 
 		 383 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1303  outer membrane porin  70.47 
 
 		 362 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  68.44 
 
 		 359 aa  500  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  70.06 
 
 		 496 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  68.16 
 
 		 359 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  67.6 
 
 		 359 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  67.6 
 
 		 359 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  68.16 
 
 		 359 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  67.6 
 
 		 359 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  69.68 
 
 		 359 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  53.5 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4632  porin Gram-negative type  47.47 
 
 		 368 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.656997 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0260  outer membrane protein (porin)  48.1 
 
 		 373 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  41.08 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  41.08 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4894  porin  37.91 
 
 		 361 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  37.14 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  36.69 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  37.27 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  36.18 
 
 		 383 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  36.71 
 
 		 384 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6034  porin  36.76 
 
 		 382 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  37.53 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  36.52 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  37.14 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2717  OmpC family outer membrane porin  35.26 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000457721  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  37.43 
 
 		 372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  37.98 
 
 		 380 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  37.98 
 
 		 380 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  38.32 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  37.89 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  35.99 
 
 		 381 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  35.14 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  36.87 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  38.79 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  37.14 
 
 		 387 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  39.11 
 
 		 387 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  36.8 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  35.14 
 
 		 379 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  35.14 
 
 		 379 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  35.14 
 
 		 379 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  37.21 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  35.14 
 
 		 379 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  35.4 
 
 		 379 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  36.53 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  35.53 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  36.13 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  37.03 
 
 		 422 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  38.1 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  36.63 
 
 		 367 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  36.11 
 
 		 387 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  36.69 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  36.22 
 
 		 380 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  37.04 
 
 		 387 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  37.83 
 
 		 385 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  37.83 
 
 		 385 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  35.66 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  37.5 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  37.5 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2803  OmpC family outer membrane porin  36.1 
 
 		 360 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  37.5 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  34.38 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  36.13 
 
 		 380 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  37.27 
 
 		 375 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  35.99 
 
 		 380 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  35.99 
 
 		 380 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  37.24 
 
 		 381 aa  186  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  40.82 
 
 		 362 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  40.82 
 
 		 362 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  40.82 
 
 		 362 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  34.56 
 
 		 382 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  36.91 
 
 		 379 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  35.89 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  37.27 
 
 		 375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  37.27 
 
 		 375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  35.82 
 
 		 384 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  35.52 
 
 		 391 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4271  porin  35.2 
 
 		 370 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  34.3 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  35.31 
 
 		 384 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  35.31 
 
 		 384 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  36.04 
 
 		 396 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  36.81 
 
 		 379 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1102  outer membrane porin  35.71 
 
 		 358 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  36.19 
 
 		 408 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2524  OmpC family outer membrane porin  36.19 
 
 		 362 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510501  normal  0.104939 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  35.79 
 
 		 383 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  34.35 
 
 		 359 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  34.63 
 
 		 395 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  37 
 
 		 379 aa  179  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  37.56 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  37.56 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>