More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2717 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2717  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 355 aa  719    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000457721  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2803  OmpC family outer membrane porin  53.61 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  40.75 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  38.73 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  38.44 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  38.44 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  38.44 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  38.73 
 
 		 359 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  38.44 
 
 		 359 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  39.19 
 
 		 496 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  38.68 
 
 		 383 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  38.68 
 
 		 432 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  38.68 
 
 		 383 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  38.68 
 
 		 362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  38.68 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  38.68 
 
 		 362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1303  outer membrane porin  38.44 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4632  porin Gram-negative type  37.11 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.656997 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  36.64 
 
 		 357 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  36.09 
 
 		 357 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  36.01 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  35.26 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  35.25 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  35.25 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6034  porin  35.2 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4894  porin  34.26 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0260  outer membrane protein (porin)  35.45 
 
 		 373 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0916  OmpC family outer membrane porin  35.6 
 
 		 365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000226254  normal  0.19283 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  34.27 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  34.51 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  34.27 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0218  OmpC family outer membrane porin  35.48 
 
 		 392 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  33.17 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  32.48 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  31.96 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  34.5 
 
 		 400 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  32.98 
 
 		 380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  32.53 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  32.53 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  32.53 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  32.53 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  32.53 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  32.53 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  32.53 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  34.96 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  36.11 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  36.11 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  35.13 
 
 		 383 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  34 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  33.25 
 
 		 396 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  34.92 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0910  OmpC family outer membrane porin  31.59 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106458  normal  0.0412885 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  33.94 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  32.26 
 
 		 481 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  34.94 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  33.81 
 
 		 359 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  34.2 
 
 		 381 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  30.95 
 
 		 378 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  33.92 
 
 		 388 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  32.9 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  31.03 
 
 		 382 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  31.22 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  31.3 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  32.98 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  32.33 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  31.58 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  33.07 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  36.24 
 
 		 377 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  32.47 
 
 		 375 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  34.53 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  33.52 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  33.76 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  31.3 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  35.63 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  31.3 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  34.22 
 
 		 372 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  35.34 
 
 		 377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  33.96 
 
 		 372 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  30.67 
 
 		 379 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  31.7 
 
 		 375 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  31.7 
 
 		 375 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  32.72 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  33.58 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  31.3 
 
 		 379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  32.32 
 
 		 383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  31.3 
 
 		 379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  32.32 
 
 		 383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  31.3 
 
 		 379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  29.7 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  31.88 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  33.51 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  33.51 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  33.51 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  33.51 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  31.9 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  33.42 
 
 		 374 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  33 
 
 		 383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0072  porin Gram-negative type  32.64 
 
 		 385 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  31.35 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  32.83 
 
 		 402 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>