More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4631 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  100 
 
 		 366 aa  738    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  100 
 
 		 366 aa  738    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4894  porin  47.66 
 
 		 361 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  42.97 
 
 		 357 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  43.34 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  43.34 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  43.34 
 
 		 432 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  43.34 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  43.34 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  43.34 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1303  outer membrane porin  43.14 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  42.43 
 
 		 357 aa  255  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  41.62 
 
 		 357 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  41.88 
 
 		 496 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4632  porin Gram-negative type  39.95 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.656997 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6034  porin  39.95 
 
 		 382 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  38.59 
 
 		 357 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  40.34 
 
 		 359 aa  235  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  40.06 
 
 		 359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  39.5 
 
 		 359 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  39.5 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  39.5 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  39.78 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  39.78 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0260  outer membrane protein (porin)  39.46 
 
 		 373 aa  222  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2803  OmpC family outer membrane porin  37.78 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  39.24 
 
 		 392 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2717  OmpC family outer membrane porin  36.07 
 
 		 355 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000457721  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  38.99 
 
 		 379 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  36.62 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  36.87 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  37.19 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  36.52 
 
 		 381 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  37.12 
 
 		 383 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  39.29 
 
 		 383 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  39.04 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  36.11 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  37 
 
 		 409 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  37 
 
 		 409 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  36.52 
 
 		 381 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  35.93 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  38.62 
 
 		 374 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  37 
 
 		 391 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  35.93 
 
 		 436 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  35.93 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  38.93 
 
 		 381 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  35.93 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  35.93 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  35.93 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  36.77 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  36.71 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  35.93 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  36.52 
 
 		 384 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  35.86 
 
 		 384 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  36.08 
 
 		 375 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  35.18 
 
 		 436 aa  189  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  35.93 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  35.93 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  35.93 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  34.95 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  35.68 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  36.18 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  36.73 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  36.73 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  36.43 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  34.75 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  35.68 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  38.4 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  36.29 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  35.66 
 
 		 384 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  35.66 
 
 		 384 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  38.13 
 
 		 380 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  35.66 
 
 		 384 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  35.66 
 
 		 384 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  35.66 
 
 		 384 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  36.22 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  35.71 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  36.87 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  35.57 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  35.57 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0072  porin Gram-negative type  35.03 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  34.84 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  34.92 
 
 		 366 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  36.18 
 
 		 380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  36.39 
 
 		 389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0218  OmpC family outer membrane porin  36.29 
 
 		 392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  34.43 
 
 		 389 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  36.77 
 
 		 379 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  35.14 
 
 		 384 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  34.22 
 
 		 380 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  34.51 
 
 		 386 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  34.78 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  34.78 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  34.78 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  33.67 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  35.46 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  36.68 
 
 		 374 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  34.25 
 
 		 366 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  36.12 
 
 		 380 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  34.25 
 
 		 366 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>