More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2524 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2524  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 362 aa  733    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510501  normal  0.104939 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4632  porin Gram-negative type  35.28 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.656997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  36.19 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  37.88 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  36.19 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  37.29 
 
 		 496 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  37.33 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  37.36 
 
 		 359 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  34.52 
 
 		 357 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  36.9 
 
 		 362 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  36.9 
 
 		 362 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  37.18 
 
 		 359 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  34.9 
 
 		 366 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  34.9 
 
 		 366 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  36.9 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  36.9 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  36.9 
 
 		 432 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  36.93 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  36.9 
 
 		 397 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  36.93 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  37.04 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1303  outer membrane porin  36.65 
 
 		 362 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  34.25 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  35.88 
 
 		 366 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  35.88 
 
 		 366 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4894  porin  32.78 
 
 		 361 aa  165  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6034  porin  32.41 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  35.13 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  33.84 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  33.84 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  33.84 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  33.84 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  33.84 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  33.84 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  33.84 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  33.84 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  31.95 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  34.63 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  33.25 
 
 		 385 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  34.96 
 
 		 383 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  34.37 
 
 		 383 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  34.37 
 
 		 383 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  33.25 
 
 		 385 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  32.09 
 
 		 396 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  32.79 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  33.33 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  33.08 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  32.01 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  31.28 
 
 		 390 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  33 
 
 		 389 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  32.75 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  32.98 
 
 		 379 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  33.91 
 
 		 381 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  31.35 
 
 		 376 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  31.5 
 
 		 384 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  31.28 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  32.8 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  30.51 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  32.8 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  31.28 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  31.27 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0218  OmpC family outer membrane porin  31.44 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  30.1 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  32.04 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0260  outer membrane protein (porin)  31.03 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  35.34 
 
 		 381 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  31.66 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  31.66 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  31.66 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  33.91 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  31.66 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  32.53 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  31.66 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0910  OmpC family outer membrane porin  30.51 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106458  normal  0.0412885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  31.05 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  33.33 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  33.33 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  32.71 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  33.77 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  33.51 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  31.81 
 
 		 375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  33.06 
 
 		 379 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2803  OmpC family outer membrane porin  32.05 
 
 		 360 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  32.65 
 
 		 402 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  31.2 
 
 		 399 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  31.99 
 
 		 375 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  30.77 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  32.35 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  38.32 
 
 		 394 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  32.78 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  32.78 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  32.31 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  30.79 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  33.42 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  32.78 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  38.28 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  32.78 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  32.38 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  30.58 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2717  OmpC family outer membrane porin  32.29 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000457721  normal  0.182742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>