More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3019 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  95.36 
 
 
366 aa  690    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
366 aa  738    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  95.36 
 
 
366 aa  690    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  47.29 
 
 
385 aa  309  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  47.03 
 
 
385 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  47.27 
 
 
383 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  47.27 
 
 
383 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  47.27 
 
 
383 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  45.78 
 
 
389 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  46.75 
 
 
383 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  45.06 
 
 
386 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  45.06 
 
 
436 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  45.06 
 
 
386 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  45.06 
 
 
436 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  45.06 
 
 
386 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  45.06 
 
 
386 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  45.06 
 
 
386 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.81 
 
 
386 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  44.39 
 
 
389 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  44.8 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  43.82 
 
 
364 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  43.19 
 
 
386 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  43.88 
 
 
383 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  43.81 
 
 
381 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  42.93 
 
 
394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  42.93 
 
 
383 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  44.95 
 
 
384 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  44.95 
 
 
384 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  44.95 
 
 
384 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  44.95 
 
 
384 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  44.95 
 
 
384 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  44.95 
 
 
384 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  44.95 
 
 
384 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  43.43 
 
 
394 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  44.53 
 
 
414 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  43.08 
 
 
387 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  42.96 
 
 
396 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  43.78 
 
 
375 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  43.78 
 
 
375 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  43.04 
 
 
389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  43.7 
 
 
384 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  43.7 
 
 
384 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  43.7 
 
 
384 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  44.5 
 
 
384 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  43.52 
 
 
375 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  40.71 
 
 
383 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  44.3 
 
 
379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  42.26 
 
 
366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  42.93 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  43.54 
 
 
409 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  43.54 
 
 
409 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  42.49 
 
 
381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  42.78 
 
 
391 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  42.46 
 
 
389 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  43.58 
 
 
391 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  43.01 
 
 
381 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  42.2 
 
 
383 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0218  OmpC family outer membrane porin  42.08 
 
 
392 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219093  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  41.94 
 
 
383 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  42.42 
 
 
375 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  42.82 
 
 
384 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  39.81 
 
 
422 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  40.1 
 
 
386 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  42.38 
 
 
381 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  41.69 
 
 
383 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  42.71 
 
 
384 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  42.71 
 
 
384 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  42.71 
 
 
384 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  44.5 
 
 
384 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  42.71 
 
 
384 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  43.7 
 
 
384 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  42.71 
 
 
384 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  43.43 
 
 
384 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  42.82 
 
 
402 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  42.2 
 
 
384 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  41.28 
 
 
389 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  42.46 
 
 
384 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  41.6 
 
 
381 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  41.62 
 
 
382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  41.95 
 
 
403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  41.15 
 
 
379 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  40.05 
 
 
396 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  42.51 
 
 
374 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  40.85 
 
 
379 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  41.75 
 
 
384 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  40.05 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  40.05 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  40.05 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  41.09 
 
 
400 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  41.48 
 
 
379 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  43.94 
 
 
390 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  40.92 
 
 
383 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  41.88 
 
 
379 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  41.88 
 
 
379 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  41.88 
 
 
379 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  41.62 
 
 
379 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  41.62 
 
 
379 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  40.25 
 
 
397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  40.31 
 
 
383 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  41.19 
 
 
377 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>