More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1819 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 364 aa  740    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  44.7 
 
 		 385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  44.44 
 
 		 385 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  44.3 
 
 		 383 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  43.12 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  43.78 
 
 		 383 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  43.78 
 
 		 383 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  43.56 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  41.54 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  43.3 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  43.3 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  43.3 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  43.3 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  43.3 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  43.3 
 
 		 436 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  43.04 
 
 		 386 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  44.1 
 
 		 366 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  44.1 
 
 		 366 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  43.37 
 
 		 389 aa  262  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  43.18 
 
 		 366 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  42.2 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  38.75 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  42.23 
 
 		 383 aa  245  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  41.13 
 
 		 381 aa  245  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  40.31 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  40.26 
 
 		 383 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  38.5 
 
 		 383 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  39.02 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  39.64 
 
 		 391 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  39.95 
 
 		 381 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  38.89 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  40.15 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  38.46 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  39.33 
 
 		 395 aa  236  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  39.64 
 
 		 409 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  39.64 
 
 		 409 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  39.95 
 
 		 381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  40.52 
 
 		 380 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  39.55 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  42.15 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  39.59 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  40.62 
 
 		 380 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  38.52 
 
 		 389 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  40.05 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  41.48 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  39.79 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  37.89 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  39.79 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  38.78 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  41.48 
 
 		 380 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  39.95 
 
 		 379 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  40 
 
 		 383 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  39.12 
 
 		 383 aa  225  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  41.3 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  40.31 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  39.74 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  40.41 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  40.05 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  40.05 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  39.79 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  38.48 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  39.79 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  39.79 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  38.4 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  39.79 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  39.3 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  38.29 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  39.73 
 
 		 367 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  39.07 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  37.69 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  38.74 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  37.09 
 
 		 421 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  37.09 
 
 		 421 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  37.34 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  37.59 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  37.09 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  40.52 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  40.21 
 
 		 403 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  38.78 
 
 		 391 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  37.44 
 
 		 397 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  39.74 
 
 		 374 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  40.31 
 
 		 380 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  37.34 
 
 		 397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  35.73 
 
 		 370 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  39.64 
 
 		 384 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  39.64 
 
 		 384 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  39.64 
 
 		 384 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  39.64 
 
 		 384 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  40.66 
 
 		 384 aa  215  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  40.87 
 
 		 411 aa  215  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  38.58 
 
 		 418 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  39.64 
 
 		 384 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  39.64 
 
 		 384 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  39.64 
 
 		 384 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  39.64 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  37.4 
 
 		 379 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1988  outer membrane porin  38.2 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  40.05 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  38.48 
 
 		 471 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0328  OmpC family outer membrane porin  40.68 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000489556  normal  0.173694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>