More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0589 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  83.42 
 
 
380 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  94.2 
 
 
379 aa  705    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  83.42 
 
 
380 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  83.42 
 
 
383 aa  652    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
379 aa  771    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  95.51 
 
 
379 aa  714    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  96.57 
 
 
379 aa  725    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  96.57 
 
 
379 aa  725    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  83.68 
 
 
481 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  83.42 
 
 
383 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  95.51 
 
 
379 aa  714    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  83.42 
 
 
383 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  83.42 
 
 
383 aa  652    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  83.42 
 
 
383 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  96.57 
 
 
379 aa  725    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  76.58 
 
 
380 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  72.77 
 
 
382 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  72.25 
 
 
382 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  47.2 
 
 
371 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  39.85 
 
 
383 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  39.27 
 
 
389 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  40.94 
 
 
385 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  40.69 
 
 
385 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  39.07 
 
 
383 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  39.07 
 
 
383 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  38.82 
 
 
383 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  37.25 
 
 
395 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  41.85 
 
 
384 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  40 
 
 
387 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  41.38 
 
 
388 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  40.55 
 
 
384 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  40.44 
 
 
359 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  38.21 
 
 
436 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  41.48 
 
 
387 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  38.21 
 
 
386 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  38.21 
 
 
386 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  38.21 
 
 
436 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  38.21 
 
 
386 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  38.21 
 
 
386 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  38.21 
 
 
386 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  39.95 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  40.3 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  38.21 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  39.36 
 
 
386 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  39.9 
 
 
402 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  39.4 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  39.03 
 
 
379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  38.56 
 
 
381 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  39.45 
 
 
383 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  39.74 
 
 
424 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  39.74 
 
 
382 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  39.22 
 
 
389 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  40 
 
 
422 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  39.74 
 
 
389 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  39.74 
 
 
382 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  39.21 
 
 
383 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  37.93 
 
 
387 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  40.68 
 
 
374 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  38.99 
 
 
388 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  40.41 
 
 
385 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  40.41 
 
 
385 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  37.62 
 
 
381 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  37.75 
 
 
383 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  38.65 
 
 
387 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  40.15 
 
 
385 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  37.28 
 
 
391 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  37.41 
 
 
393 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  41.58 
 
 
394 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  37.34 
 
 
375 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  39.73 
 
 
379 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  41.3 
 
 
394 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  41.3 
 
 
394 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  37.28 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  41.03 
 
 
394 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  38.42 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  39.19 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  37.97 
 
 
379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  37.97 
 
 
379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  37.97 
 
 
379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  36.21 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  37.97 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  36.55 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  37.69 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  36.23 
 
 
386 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  37.72 
 
 
379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  36.62 
 
 
387 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  37.47 
 
 
379 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  39.08 
 
 
396 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  35.65 
 
 
400 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  36.83 
 
 
384 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  36.87 
 
 
408 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  36.83 
 
 
389 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  38.07 
 
 
364 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  36.06 
 
 
409 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  36.59 
 
 
366 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  36.59 
 
 
366 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  37.56 
 
 
383 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  37.53 
 
 
384 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  39.43 
 
 
374 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  37.41 
 
 
375 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>