More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2044 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  91.73 
 
 
387 aa  735    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 
387 aa  781    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  54.26 
 
 
383 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  55.3 
 
 
388 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  53.75 
 
 
384 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  55.95 
 
 
387 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  54.38 
 
 
386 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  53.52 
 
 
384 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  53.66 
 
 
388 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  52.58 
 
 
386 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  54.67 
 
 
422 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  53.57 
 
 
424 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  53.57 
 
 
382 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  51.93 
 
 
387 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  53.57 
 
 
382 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  52.03 
 
 
385 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  52.03 
 
 
385 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  52.03 
 
 
385 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1502  porin, interruption-N  56.81 
 
 
278 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980797  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  39.8 
 
 
383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  39.8 
 
 
383 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  39.7 
 
 
381 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  39.16 
 
 
381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  40 
 
 
379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  40 
 
 
379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  40 
 
 
379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  39.75 
 
 
379 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  39.75 
 
 
379 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  38.67 
 
 
381 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  39.07 
 
 
381 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  39.54 
 
 
374 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  38.92 
 
 
379 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  36.5 
 
 
436 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  36.83 
 
 
383 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  36.5 
 
 
386 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  36.5 
 
 
386 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  36.5 
 
 
386 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  36.5 
 
 
386 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  36.5 
 
 
386 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  38.82 
 
 
379 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  39.33 
 
 
379 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  38.82 
 
 
379 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  38.82 
 
 
379 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  38.92 
 
 
379 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  39.07 
 
 
379 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  39.07 
 
 
379 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  39.33 
 
 
380 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  36.25 
 
 
386 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  37.16 
 
 
380 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  39.33 
 
 
380 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  39.28 
 
 
390 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  39.02 
 
 
390 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  36.76 
 
 
383 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  38.82 
 
 
379 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  38.15 
 
 
380 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  39.02 
 
 
390 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  39.79 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  37.75 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  36.52 
 
 
383 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  35.92 
 
 
389 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  35.77 
 
 
436 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  36.52 
 
 
383 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  37.5 
 
 
385 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  37.22 
 
 
376 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  37.22 
 
 
376 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  37.22 
 
 
376 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  37.22 
 
 
376 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  38.16 
 
 
385 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  36.9 
 
 
374 aa  199  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  36.9 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  37.94 
 
 
481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  39.53 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  39.53 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  37.75 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  37.75 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  36.9 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  37.37 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  37.75 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  36.9 
 
 
374 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  37.75 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  37.75 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  37.75 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  37.75 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  37.96 
 
 
390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  39.22 
 
 
390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  37.5 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  37.5 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  38.18 
 
 
380 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  37.5 
 
 
383 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  37.5 
 
 
383 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  38.18 
 
 
380 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  37.8 
 
 
430 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  37.8 
 
 
430 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  37.01 
 
 
496 aa  196  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  37.5 
 
 
397 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  37.8 
 
 
430 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  37.5 
 
 
432 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  37.69 
 
 
380 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  37.4 
 
 
357 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1303  outer membrane porin  37.33 
 
 
362 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>