More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1853 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  98.16 
 
 		 380 aa  765    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  86.43 
 
 		 379 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  85.32 
 
 		 379 aa  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  97.91 
 
 		 383 aa  771    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  97.91 
 
 		 383 aa  771    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  98.16 
 
 		 380 aa  765    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  85.32 
 
 		 379 aa  648    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  86.27 
 
 		 379 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  97.91 
 
 		 383 aa  771    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  97.91 
 
 		 383 aa  771    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  100 
 
 		 481 aa  980    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  97.91 
 
 		 383 aa  771    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  85.87 
 
 		 379 aa  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  85.32 
 
 		 379 aa  648    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  85.87 
 
 		 379 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  77.75 
 
 		 382 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  77.23 
 
 		 382 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  77.37 
 
 		 380 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  47.63 
 
 		 371 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  43.77 
 
 		 384 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  42.04 
 
 		 387 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  39.85 
 
 		 385 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  42.22 
 
 		 388 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  39.6 
 
 		 385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  42.42 
 
 		 387 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  40.54 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  40.79 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  40.79 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  40.79 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  40.79 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  40.79 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  40.79 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  39.11 
 
 		 389 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  40.79 
 
 		 386 aa  230  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  40.44 
 
 		 384 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  40.95 
 
 		 383 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  39.6 
 
 		 383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  39.6 
 
 		 383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  39.95 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  39.66 
 
 		 386 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  40.65 
 
 		 386 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  38.29 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  42.71 
 
 		 385 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  42.71 
 
 		 385 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  39.11 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  40.86 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  42.46 
 
 		 385 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  40.1 
 
 		 422 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  39.95 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  41.09 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  39.84 
 
 		 424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  39.79 
 
 		 388 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  39.84 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  39.84 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  38.67 
 
 		 359 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  40.05 
 
 		 389 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  39.19 
 
 		 379 aa  209  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  39.8 
 
 		 383 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  39.55 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  40.41 
 
 		 374 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  37.53 
 
 		 383 aa  204  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  37.81 
 
 		 387 aa  203  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  37.8 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  38.46 
 
 		 375 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  38.71 
 
 		 379 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  38.71 
 
 		 379 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  38.71 
 
 		 379 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  38.71 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  38.46 
 
 		 379 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  39.68 
 
 		 379 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  37.4 
 
 		 380 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  37.16 
 
 		 393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  38.86 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  37.13 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  36.93 
 
 		 386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  36.1 
 
 		 391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  38.16 
 
 		 396 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  38.1 
 
 		 381 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  36.09 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  36.93 
 
 		 387 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  36.97 
 
 		 408 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  36.63 
 
 		 383 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  37.91 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  37.97 
 
 		 379 aa  193  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  40.45 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  37.03 
 
 		 367 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  40.45 
 
 		 374 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  37.27 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  37.27 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  35.22 
 
 		 379 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  36.32 
 
 		 389 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  38.25 
 
 		 380 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  40.45 
 
 		 374 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  37.92 
 
 		 384 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  40.45 
 
 		 374 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  37.14 
 
 		 378 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  39.14 
 
 		 384 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  37.15 
 
 		 384 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  39.14 
 
 		 384 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  40.25 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>