More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0466 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  99.74 
 
 
424 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  100 
 
 
382 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  97.64 
 
 
422 aa  677    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  100 
 
 
382 aa  758    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  78.7 
 
 
383 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  79.02 
 
 
384 aa  594  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  81.35 
 
 
386 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  80.83 
 
 
386 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  74.23 
 
 
384 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  82.08 
 
 
385 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  81.82 
 
 
385 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  82.08 
 
 
385 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  73.64 
 
 
387 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  69.33 
 
 
388 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  68.35 
 
 
388 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  62.56 
 
 
387 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1502  porin, interruption-N  99.58 
 
 
278 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980797  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  54.81 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  53.77 
 
 
387 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1505  porin, interruption-C  99.25 
 
 
133 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  41.87 
 
 
436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  41.87 
 
 
386 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  41.87 
 
 
386 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  41.87 
 
 
386 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  41.87 
 
 
386 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  41.87 
 
 
386 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  41.63 
 
 
436 aa  258  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  41.94 
 
 
383 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  41.94 
 
 
383 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  41.63 
 
 
386 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  44 
 
 
384 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  44 
 
 
384 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  44 
 
 
384 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  41.44 
 
 
383 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  41.91 
 
 
391 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  43.24 
 
 
390 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  41.91 
 
 
409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  41.91 
 
 
409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  44.62 
 
 
363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  43.75 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  43.75 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  43.75 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  43.75 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  42.96 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  41.52 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  41.94 
 
 
383 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  41.28 
 
 
385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  42.51 
 
 
380 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  42.47 
 
 
381 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  43.38 
 
 
383 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  42.79 
 
 
389 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  42.63 
 
 
385 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  40.15 
 
 
389 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  43.14 
 
 
383 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  42.36 
 
 
380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  42.82 
 
 
389 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  45.34 
 
 
374 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  41.77 
 
 
383 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  42.86 
 
 
383 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  42.36 
 
 
380 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  45.34 
 
 
374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  45.34 
 
 
374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  43 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  41.28 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  45.11 
 
 
376 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  45.11 
 
 
376 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  45.11 
 
 
376 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  45.11 
 
 
376 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  45.34 
 
 
374 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  42.3 
 
 
379 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  41.46 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  42.09 
 
 
390 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  42.05 
 
 
379 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  42.05 
 
 
379 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  41.81 
 
 
379 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  42.05 
 
 
379 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  41.81 
 
 
379 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  41.03 
 
 
380 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  42.16 
 
 
380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  43.91 
 
 
374 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  42.05 
 
 
390 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  42.31 
 
 
390 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  43.94 
 
 
374 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  42.31 
 
 
390 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  41.09 
 
 
383 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  41.67 
 
 
402 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  40.74 
 
 
381 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  42.16 
 
 
379 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  41.09 
 
 
381 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  42.05 
 
 
390 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  44.1 
 
 
362 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  44.1 
 
 
362 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  40.99 
 
 
381 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  44.1 
 
 
362 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  40.48 
 
 
391 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  41.67 
 
 
372 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  42.18 
 
 
379 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  38.25 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  39.61 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  43.26 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>