More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5427 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  100 
 
 		 385 aa  758    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  87.56 
 
 		 384 aa  664    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  89.64 
 
 		 386 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  100 
 
 		 385 aa  758    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  86.01 
 
 		 383 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  99.74 
 
 		 385 aa  756    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  87.56 
 
 		 386 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  81.3 
 
 		 422 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  81.82 
 
 		 424 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  82.08 
 
 		 382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  82.08 
 
 		 382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  72.38 
 
 		 384 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  69.31 
 
 		 388 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  70.51 
 
 		 387 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  66.67 
 
 		 388 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  61.32 
 
 		 387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  53.23 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  51.94 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1502  porin, interruption-N  87.34 
 
 		 278 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980797  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  45.48 
 
 		 380 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  44.74 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  47.1 
 
 		 374 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  47.1 
 
 		 374 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  45.23 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  46.6 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  43.75 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  44 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  46.85 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  44 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  43.41 
 
 		 436 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  43.41 
 
 		 386 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  43.41 
 
 		 386 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  43.41 
 
 		 386 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  43.41 
 
 		 386 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  43.41 
 
 		 386 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  43.75 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  43.75 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  43.75 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  45.82 
 
 		 374 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  46.04 
 
 		 363 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  43.5 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  42.68 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  43.17 
 
 		 386 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  43.93 
 
 		 390 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  43.14 
 
 		 380 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  46.62 
 
 		 376 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  45.12 
 
 		 383 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  44.33 
 
 		 383 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  46.62 
 
 		 376 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  46.62 
 
 		 376 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  46.62 
 
 		 376 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  45.12 
 
 		 383 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  43.84 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  43.85 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  42.26 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  43.84 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  42.89 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  44.09 
 
 		 383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  43.85 
 
 		 379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  44.06 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  45.43 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  43.48 
 
 		 390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  43.2 
 
 		 390 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  42.86 
 
 		 383 aa  252  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  42.93 
 
 		 385 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  42.68 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  42.89 
 
 		 391 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  42.65 
 
 		 381 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  43.31 
 
 		 409 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  43.72 
 
 		 409 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  43.31 
 
 		 409 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  44.87 
 
 		 372 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  44.87 
 
 		 372 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  44.09 
 
 		 381 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  44.2 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  44.2 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  42.61 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  42.12 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  45.08 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  44.2 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  43.95 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  45.57 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  45.57 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  42.26 
 
 		 385 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  43.46 
 
 		 379 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  45.57 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  43.95 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  39.41 
 
 		 383 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  41.38 
 
 		 383 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  41.91 
 
 		 383 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  43.63 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  43.8 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  44.13 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  41.32 
 
 		 387 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  45.06 
 
 		 389 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  43.88 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  41.5 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  41.58 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  42.27 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  43.14 
 
 		 380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>