More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1505 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  99.25 
 
 
424 aa  270  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  99.25 
 
 
382 aa  269  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  99.25 
 
 
382 aa  269  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1505  porin, interruption-C  100 
 
 
133 aa  268  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  96.99 
 
 
422 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  68.84 
 
 
388 aa  199  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  71.01 
 
 
384 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  70.8 
 
 
387 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  72.59 
 
 
385 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  72.59 
 
 
385 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  72.59 
 
 
385 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  71.32 
 
 
386 aa  187  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  71.32 
 
 
384 aa  187  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  69.12 
 
 
383 aa  185  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  69.12 
 
 
386 aa  180  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  63.77 
 
 
388 aa  176  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  50.36 
 
 
387 aa  140  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  50.35 
 
 
387 aa  140  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  50.36 
 
 
387 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  47.06 
 
 
363 aa  104  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  47.45 
 
 
374 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  47.45 
 
 
374 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  47.45 
 
 
374 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  47.45 
 
 
374 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  46.76 
 
 
376 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  46.76 
 
 
376 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  46.76 
 
 
376 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  46.76 
 
 
376 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  42.65 
 
 
372 aa  95.9  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  42.65 
 
 
372 aa  95.9  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  41.91 
 
 
361 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  44.62 
 
 
385 aa  93.2  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  39.86 
 
 
383 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  43.36 
 
 
377 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  42.76 
 
 
377 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  41.91 
 
 
362 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  41.91 
 
 
362 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  41.91 
 
 
362 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  40 
 
 
385 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  43.36 
 
 
390 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  43.36 
 
 
390 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  40 
 
 
385 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  39.74 
 
 
383 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  39.16 
 
 
383 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  39.04 
 
 
389 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  39.16 
 
 
383 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  43.36 
 
 
390 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  38.62 
 
 
389 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  44.93 
 
 
390 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  39.16 
 
 
383 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  43.36 
 
 
390 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  43.36 
 
 
390 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  37.24 
 
 
412 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  39.74 
 
 
383 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  44.12 
 
 
390 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  40.43 
 
 
380 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  42.65 
 
 
374 aa  87.8  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  40.56 
 
 
400 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  42.36 
 
 
375 aa  87  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  41.78 
 
 
384 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  38.03 
 
 
436 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  38.36 
 
 
389 aa  87  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  41.78 
 
 
384 aa  86.7  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  41.78 
 
 
384 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  41.78 
 
 
384 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  41.78 
 
 
384 aa  86.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  41.78 
 
 
384 aa  86.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  38.03 
 
 
436 aa  86.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  37.5 
 
 
386 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  37.5 
 
 
386 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  37.5 
 
 
386 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  37.5 
 
 
386 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  37.5 
 
 
386 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  37.5 
 
 
386 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  41.1 
 
 
384 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  39.86 
 
 
400 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  42.11 
 
 
372 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  45 
 
 
430 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  45 
 
 
390 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  45 
 
 
430 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  45 
 
 
430 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  45 
 
 
430 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  45 
 
 
430 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  45 
 
 
430 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  38.82 
 
 
384 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  39.73 
 
 
383 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  39.86 
 
 
372 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  35.86 
 
 
395 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  34.87 
 
 
384 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  37.93 
 
 
383 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  34.93 
 
 
388 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  39.72 
 
 
384 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  39.72 
 
 
384 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  39.72 
 
 
384 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  40.74 
 
 
389 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  39.72 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  35.62 
 
 
380 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  38.41 
 
 
380 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  39.72 
 
 
430 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  39.72 
 
 
430 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>