More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0844 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  100 
 
 
380 aa  769    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  100 
 
 
383 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  86.15 
 
 
379 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  100 
 
 
380 aa  769    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  100 
 
 
383 aa  776    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  85.04 
 
 
379 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  85.99 
 
 
379 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  100 
 
 
383 aa  776    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  85.6 
 
 
379 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  97.91 
 
 
481 aa  770    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  85.04 
 
 
379 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  85.04 
 
 
379 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  100 
 
 
383 aa  776    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  100 
 
 
383 aa  776    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  85.6 
 
 
379 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  76.96 
 
 
382 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  76.44 
 
 
382 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  76.84 
 
 
380 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  47.61 
 
 
371 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  43.14 
 
 
384 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  42.04 
 
 
387 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  39.6 
 
 
385 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  42.22 
 
 
388 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  39.36 
 
 
385 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  42.28 
 
 
387 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  40.29 
 
 
436 aa  229  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  38.86 
 
 
389 aa  229  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  40.54 
 
 
436 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  40.54 
 
 
386 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  40.54 
 
 
386 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  40.54 
 
 
386 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  40.54 
 
 
386 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  40.54 
 
 
386 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  40.54 
 
 
386 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  38.29 
 
 
395 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  39.11 
 
 
383 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  40.94 
 
 
384 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  39.11 
 
 
383 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  39.45 
 
 
383 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  41.22 
 
 
383 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  40.4 
 
 
386 aa  222  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  40.15 
 
 
386 aa  222  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  42.46 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  42.46 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  38.61 
 
 
383 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  42.2 
 
 
385 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  40.59 
 
 
385 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  40.2 
 
 
402 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  40.83 
 
 
389 aa  216  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  40.1 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  39.23 
 
 
359 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  40.31 
 
 
389 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  39.84 
 
 
424 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  39.53 
 
 
388 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  39.84 
 
 
382 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  39.84 
 
 
382 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  38.68 
 
 
379 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  39.3 
 
 
383 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  39.64 
 
 
374 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  39.05 
 
 
383 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  38.11 
 
 
375 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  37.72 
 
 
387 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  37.66 
 
 
393 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  37.11 
 
 
383 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  37.07 
 
 
391 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  36.93 
 
 
386 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  36.1 
 
 
391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  38.41 
 
 
396 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  38.06 
 
 
379 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  38.06 
 
 
379 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  38.06 
 
 
379 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  36.76 
 
 
380 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  36.95 
 
 
387 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  38.06 
 
 
379 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  37.81 
 
 
379 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  38.73 
 
 
379 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  38.37 
 
 
381 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  36.73 
 
 
408 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  37.53 
 
 
366 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  37.53 
 
 
366 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  37.38 
 
 
389 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  35.61 
 
 
381 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  36.43 
 
 
387 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  40 
 
 
374 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  37.34 
 
 
381 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  36.08 
 
 
383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  40.53 
 
 
374 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  36.3 
 
 
400 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4271  porin  36.66 
 
 
370 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  37.3 
 
 
366 aa  189  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  40.53 
 
 
374 aa  189  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  40.53 
 
 
374 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  37.19 
 
 
367 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  37.31 
 
 
379 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  37.56 
 
 
381 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  35.22 
 
 
379 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  36.06 
 
 
400 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  40.31 
 
 
376 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  40.31 
 
 
376 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  37.01 
 
 
366 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>