More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1471 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 371 aa  756    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  48.89 
 
 		 379 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  48.61 
 
 		 379 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  48.61 
 
 		 379 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  48.33 
 
 		 379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  47.78 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  47.78 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  47.78 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  47.81 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  47.61 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  47.61 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  47.61 
 
 		 383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  47.61 
 
 		 383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  47.61 
 
 		 383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  47.61 
 
 		 383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  47.61 
 
 		 383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  47.63 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  46.56 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  46.01 
 
 		 382 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  40.61 
 
 		 359 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  41.79 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  41.54 
 
 		 385 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  40.05 
 
 		 389 aa  225  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  40.4 
 
 		 383 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  40.15 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  40.15 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  39.9 
 
 		 383 aa  215  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  39.46 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  38.11 
 
 		 396 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  39.46 
 
 		 386 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  39.46 
 
 		 386 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  39.46 
 
 		 436 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  39.46 
 
 		 386 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  39.46 
 
 		 386 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  39.46 
 
 		 386 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  40.31 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  39.46 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  40.72 
 
 		 389 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  38.02 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  38.84 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  38.42 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  38.97 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  39.9 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  36.23 
 
 		 391 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  36.3 
 
 		 391 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  38.26 
 
 		 379 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  39.34 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  39.34 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  39.24 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  38.95 
 
 		 383 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  35.29 
 
 		 399 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  39.29 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  38.68 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  38.68 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  35.51 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  37.84 
 
 		 388 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  38 
 
 		 383 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  38.6 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  34.7 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  34.72 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  34.72 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  34.72 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  34.72 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  35.44 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  37.28 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  38.15 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  35.73 
 
 		 369 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  38.44 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  35.34 
 
 		 381 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  36.18 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  36.39 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  37.66 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  34.99 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  37.47 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  34.42 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  36.6 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  36.84 
 
 		 381 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  36.25 
 
 		 379 aa  189  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  34.07 
 
 		 397 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  35.93 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  35.93 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0910  OmpC family outer membrane porin  34.56 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106458  normal  0.0412885 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  37.5 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  36.5 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  37.5 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  37.5 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  35.22 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  37.5 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  37.24 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  35.07 
 
 		 397 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  35.85 
 
 		 398 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0916  OmpC family outer membrane porin  35.84 
 
 		 365 aa  185  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000226254  normal  0.19283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  34.67 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  35.68 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  34.96 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  34.92 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  34.42 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  39.06 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  34.42 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  39.01 
 
 		 424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>