More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5007 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  83.95 
 
 		 380 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  83.95 
 
 		 383 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  97.36 
 
 		 379 aa  728    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  97.36 
 
 		 379 aa  728    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  83.95 
 
 		 383 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  83.95 
 
 		 383 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  83.95 
 
 		 380 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  83.95 
 
 		 383 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  95.51 
 
 		 379 aa  707    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  83.95 
 
 		 383 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  83.68 
 
 		 481 aa  659    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  96.04 
 
 		 379 aa  720    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  100 
 
 		 379 aa  771    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  100 
 
 		 379 aa  771    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  97.36 
 
 		 379 aa  728    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  76.32 
 
 		 380 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  73.56 
 
 		 382 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  72.77 
 
 		 382 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  47.09 
 
 		 371 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  41.94 
 
 		 385 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  41.69 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  43.31 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  39.71 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  40.3 
 
 		 383 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  42.51 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  39.56 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  39.95 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  39.56 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  39.21 
 
 		 436 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  39.31 
 
 		 383 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  41.46 
 
 		 384 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  42.24 
 
 		 387 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  39.21 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  39.21 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  41.29 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  39.21 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  39.21 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  39.21 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  39.21 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  39.21 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  40.19 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  37.25 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  40.29 
 
 		 386 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  40.16 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  40.32 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  40.15 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  39.05 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  40.52 
 
 		 389 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  38.96 
 
 		 389 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  40.78 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  38.63 
 
 		 383 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  40.52 
 
 		 424 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  40.52 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  40.52 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  40.25 
 
 		 383 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  41.18 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  38.46 
 
 		 381 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  41.18 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  40 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  38.02 
 
 		 391 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  40 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  40.92 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  38.18 
 
 		 387 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  40.94 
 
 		 374 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  38.65 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  38.14 
 
 		 381 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  38.32 
 
 		 408 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  37.72 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  37.1 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  37.44 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  38.23 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  38.52 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  36.99 
 
 		 375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  37.88 
 
 		 379 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  40.76 
 
 		 394 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  37.88 
 
 		 379 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  37.88 
 
 		 379 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  39.1 
 
 		 379 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  40.76 
 
 		 394 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  37.88 
 
 		 379 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  40.49 
 
 		 394 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  37.97 
 
 		 375 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  37.84 
 
 		 381 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  38.21 
 
 		 381 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  37.97 
 
 		 375 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  37.63 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  40.49 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  36.87 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  37.97 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  37.4 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  37.4 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  37.23 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  37.11 
 
 		 400 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  36.87 
 
 		 379 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  37.88 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  38.02 
 
 		 384 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  37.37 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  38.97 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  35.65 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  36.83 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>