More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0482 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
357 aa  725    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  53.5 
 
 
357 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  52.66 
 
 
357 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  54.2 
 
 
362 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  54.2 
 
 
397 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  54.2 
 
 
362 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  51.54 
 
 
357 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  54.2 
 
 
432 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  54.2 
 
 
383 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  54.2 
 
 
383 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1303  outer membrane porin  54.09 
 
 
362 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  52.54 
 
 
359 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  53.06 
 
 
496 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  53.67 
 
 
359 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  51.98 
 
 
359 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  50 
 
 
359 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  50 
 
 
359 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  52.6 
 
 
359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  52.31 
 
 
359 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0260  outer membrane protein (porin)  45.77 
 
 
373 aa  278  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4632  porin Gram-negative type  40.95 
 
 
368 aa  245  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.656997 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  37.87 
 
 
366 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  37.87 
 
 
366 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4894  porin  36.26 
 
 
361 aa  216  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  37.02 
 
 
383 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2717  OmpC family outer membrane porin  36.01 
 
 
355 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000457721  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  36.5 
 
 
383 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  35.23 
 
 
381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  37.57 
 
 
379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  35.49 
 
 
381 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  38.42 
 
 
375 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  37.21 
 
 
380 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  34.97 
 
 
381 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  37.37 
 
 
375 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  37.37 
 
 
375 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  36.6 
 
 
384 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  33.76 
 
 
383 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  36.29 
 
 
358 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  37.21 
 
 
380 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  33.51 
 
 
383 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  34.2 
 
 
379 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  34.46 
 
 
379 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  34.46 
 
 
379 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  34.46 
 
 
379 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  34.46 
 
 
379 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  34.73 
 
 
380 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  35.1 
 
 
387 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  34.14 
 
 
374 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  34.2 
 
 
379 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6034  porin  37.09 
 
 
382 aa  189  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  38.23 
 
 
375 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  35.97 
 
 
380 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  35.97 
 
 
380 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  37.11 
 
 
375 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  34.46 
 
 
380 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2803  OmpC family outer membrane porin  34.45 
 
 
360 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011499  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  37.12 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  34.45 
 
 
381 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  36.96 
 
 
367 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  34.41 
 
 
383 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  34.73 
 
 
382 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  33.7 
 
 
378 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0218  OmpC family outer membrane porin  35.31 
 
 
392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219093  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  34 
 
 
384 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  34.32 
 
 
386 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  34.53 
 
 
385 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  33.77 
 
 
380 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  34.27 
 
 
385 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  33.16 
 
 
386 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  35.48 
 
 
384 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  34.6 
 
 
392 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  35.48 
 
 
384 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  35.48 
 
 
384 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  35.48 
 
 
384 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  35.48 
 
 
384 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  35.48 
 
 
384 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  34.94 
 
 
372 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  33.76 
 
 
391 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  33.68 
 
 
382 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  34.6 
 
 
380 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  34.95 
 
 
381 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  35.22 
 
 
384 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  32.8 
 
 
386 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  34.16 
 
 
386 aa  176  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  33.08 
 
 
396 aa  176  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  35.41 
 
 
384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  35.08 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1102  outer membrane porin  35.61 
 
 
358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  32.45 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  34.67 
 
 
409 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  34.67 
 
 
409 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0910  OmpC family outer membrane porin  33.15 
 
 
354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106458  normal  0.0412885 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  34.53 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  35.47 
 
 
397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  33.84 
 
 
390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  35.66 
 
 
387 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  35.33 
 
 
365 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2322  outer membrane porin protein  35.33 
 
 
365 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1848  putative outer membrane porin  35.33 
 
 
365 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0156948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  35.33 
 
 
365 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>