More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4230 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4230  porin  100 
 
 		 357 aa  729    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  80.39 
 
 		 357 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  80.11 
 
 		 357 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  73.62 
 
 		 362 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  73.62 
 
 		 432 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  73.62 
 
 		 383 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  73.62 
 
 		 362 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  73.62 
 
 		 383 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  73.62 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1303  outer membrane porin  73.68 
 
 		 362 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  72.38 
 
 		 496 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  68.99 
 
 		 359 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  68.72 
 
 		 359 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  68.16 
 
 		 359 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  68.44 
 
 		 359 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  68.44 
 
 		 359 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  68.44 
 
 		 359 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  71.72 
 
 		 359 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  51.54 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4632  porin Gram-negative type  48.31 
 
 		 368 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.656997 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0260  outer membrane protein (porin)  48.69 
 
 		 373 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  42.43 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  42.43 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  39.06 
 
 		 381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  40 
 
 		 384 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  37.4 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  39.32 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  37.14 
 
 		 383 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  39.52 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  37.57 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  38.44 
 
 		 381 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2717  OmpC family outer membrane porin  36.64 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000457721  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  37.74 
 
 		 380 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  38.14 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  38.54 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  37.74 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  39.04 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  39.45 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  37.97 
 
 		 390 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  37.37 
 
 		 383 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  38.05 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  38.16 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  36.13 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6034  porin  36.81 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  39.73 
 
 		 385 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  36.01 
 
 		 379 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  36.69 
 
 		 379 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  36.69 
 
 		 379 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  36.69 
 
 		 379 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  36.95 
 
 		 379 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  35.94 
 
 		 380 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  37.97 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  39.47 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  39.47 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  36.43 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  36.53 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  37.31 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  37.86 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  36.34 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  35.08 
 
 		 380 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  38.08 
 
 		 383 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4894  porin  36.81 
 
 		 361 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  35.17 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  36.78 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  37.64 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  38.12 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  37.6 
 
 		 375 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  37.6 
 
 		 375 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2803  OmpC family outer membrane porin  36.57 
 
 		 360 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  34.65 
 
 		 378 aa  192  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  36.57 
 
 		 384 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  36.55 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  34.79 
 
 		 384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  35.17 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  37.53 
 
 		 379 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  37.14 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  41.49 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  41.19 
 
 		 398 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  36.72 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  36.66 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  36.07 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  36.66 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  40 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  38.17 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  40.47 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  36.07 
 
 		 422 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  36.46 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  34.66 
 
 		 387 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  34.28 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  34.28 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  40.29 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  38.17 
 
 		 386 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  38.17 
 
 		 386 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  38.17 
 
 		 386 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  34.95 
 
 		 382 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  38.17 
 
 		 386 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  38.17 
 
 		 386 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  36.34 
 
 		 424 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  37.15 
 
 		 375 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  37.11 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>