More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0260 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0260  outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 373 aa  743    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  50.72 
 
 		 362 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  50.72 
 
 		 362 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  50.72 
 
 		 397 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  50.72 
 
 		 432 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  50.72 
 
 		 383 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  50.72 
 
 		 383 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1303  outer membrane porin  50.58 
 
 		 362 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  49.86 
 
 		 496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  49 
 
 		 357 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  48.02 
 
 		 357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  47.18 
 
 		 357 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  47.44 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  45.08 
 
 		 359 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  45.63 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  45.08 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  45.08 
 
 		 359 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  45.08 
 
 		 359 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  45.08 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  45.3 
 
 		 357 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4632  porin Gram-negative type  45.63 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.656997 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  40 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  40 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6034  porin  38.65 
 
 		 382 aa  195  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4894  porin  37.64 
 
 		 361 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  34.37 
 
 		 381 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  37.53 
 
 		 385 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  35.79 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  37.28 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  35.31 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  34.88 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2717  OmpC family outer membrane porin  35.58 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000457721  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  34.97 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  34.62 
 
 		 381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  35.29 
 
 		 389 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  35.77 
 
 		 395 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  37.14 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  36.76 
 
 		 383 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  36.76 
 
 		 383 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  34.9 
 
 		 411 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  36.08 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  36.34 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  35.99 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  34.32 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  35.9 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  35.9 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  34.44 
 
 		 383 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2803  OmpC family outer membrane porin  35.34 
 
 		 360 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011499  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  34.7 
 
 		 379 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  34.7 
 
 		 379 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  34.7 
 
 		 379 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  36.13 
 
 		 387 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  34.7 
 
 		 379 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  34.45 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  35.22 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  32.65 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  36.07 
 
 		 369 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  37.03 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  34.67 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  34.42 
 
 		 409 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  34.42 
 
 		 409 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  34.81 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  33.85 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  34.42 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  36.46 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  32.15 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  34.69 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  35.09 
 
 		 384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  35.23 
 
 		 481 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  36.6 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  35.35 
 
 		 391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  33.25 
 
 		 396 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  35.04 
 
 		 386 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  35.26 
 
 		 391 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  35.07 
 
 		 386 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  36.24 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  34.86 
 
 		 379 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  34.13 
 
 		 379 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  34.15 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  35.04 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  36.39 
 
 		 395 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  34.5 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  34.11 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  34.69 
 
 		 380 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  34.69 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  34.17 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  34.69 
 
 		 380 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  36.39 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  33.15 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  34.35 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  34.42 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  34.69 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  34.69 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  34.69 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  35.89 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  34.42 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  34.69 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  34.17 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  34.17 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  34.17 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>