More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5890 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6157  porin  98.31 
 
 		 355 aa  698    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  100 
 
 		 355 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  89.61 
 
 		 356 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  74.44 
 
 		 356 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  74.44 
 
 		 356 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  74.44 
 
 		 356 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2457  porin  62.54 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0201668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  60.4 
 
 		 361 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  61.27 
 
 		 359 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  59.52 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7462  outer membrane protein (porin)  54.46 
 
 		 360 aa  350  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00141122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5613  porin  54.14 
 
 		 363 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000212183  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5977  porin  54.14 
 
 		 363 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297374  decreased coverage  0.000158153 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6767  outer membrane protein (porin)-like  51.43 
 
 		 370 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0380133  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7310  outer membrane protein (porin)  50.27 
 
 		 369 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  0.523788 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  42.15 
 
 		 351 aa  238  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0274  OmpC family outer membrane porin  41.27 
 
 		 350 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000878136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4837  outer membrane protein, (porin)  34.99 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1582  porin  34.71 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1601  porin  33.6 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32825  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6355  porin  33.16 
 
 		 398 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2036  putative outer membrane porin  33.61 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1434  putative porin protein  33.61 
 
 		 379 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2327  putative outer membrane porin  33.61 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1060  putative outer membrane porin  33.61 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3095  putative outer membrane porin  33.61 
 
 		 391 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1346  putative outer membrane porin  33.61 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.80313  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  34.13 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4265  porin Gram-negative type  32.59 
 
 		 348 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.505475 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  33.6 
 
 		 386 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  34.16 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  33.33 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  35.22 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  35.22 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  34.26 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  33.24 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  33.79 
 
 		 353 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  34.45 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  30.39 
 
 		 361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  34.45 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  33.33 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  34.45 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  31.52 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  33.6 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5230  outer membrane protein, (porin)  32.16 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  33.33 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  33.33 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  33.06 
 
 		 350 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  34.09 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  34.09 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  34.37 
 
 		 363 aa  126  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  32.91 
 
 		 376 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  32.91 
 
 		 376 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  34.09 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  32.69 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  33.24 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  33.69 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  32.91 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  32.69 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  32.4 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  32.69 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  32.9 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  32.9 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  34.01 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  31.57 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  31.49 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  33.78 
 
 		 397 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  31.46 
 
 		 379 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  33.78 
 
 		 432 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  31.46 
 
 		 379 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  33.52 
 
 		 390 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  31.23 
 
 		 382 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  34.62 
 
 		 375 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  33.61 
 
 		 362 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  33.25 
 
 		 354 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  33.61 
 
 		 362 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  33.78 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  33.78 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  32.7 
 
 		 368 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  33.06 
 
 		 349 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  34.48 
 
 		 373 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  32.79 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  33.52 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0633  putative outer membrane porin  31.46 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  33.59 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  33.59 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0832  putative outer membrane porin  31.46 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1796  putative outer membrane porin  31.46 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  31.41 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  34.27 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  33.33 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  33.42 
 
 		 373 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  30.75 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  32.52 
 
 		 379 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  33.42 
 
 		 496 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  33.06 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  34.82 
 
 		 372 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  33.24 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  34.54 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  32.75 
 
 		 379 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>