More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1141 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1141  porin  100 
 
 		 327 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  93.88 
 
 		 356 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  93.27 
 
 		 356 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  93.27 
 
 		 356 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  92.35 
 
 		 356 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0545  OmpC family outer membrane porin  39.75 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4118  porin Gram-negative type  38.55 
 
 		 342 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  36.78 
 
 		 349 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  34.45 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0935  OmpC family outer membrane porin  32.77 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000655737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  33.14 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  34.76 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  33.33 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  32.2 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  33.72 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  31.58 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  35.84 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  31.48 
 
 		 389 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  32.48 
 
 		 354 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5613  porin  32.76 
 
 		 363 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000212183  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5977  porin  32.76 
 
 		 363 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297374  decreased coverage  0.000158153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  33.23 
 
 		 394 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  31.1 
 
 		 391 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7462  outer membrane protein (porin)  33.33 
 
 		 360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00141122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  34.14 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  34.87 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  34.88 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  34.87 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  30.14 
 
 		 374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  34.88 
 
 		 385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  34.46 
 
 		 383 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  34.58 
 
 		 356 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  33.33 
 
 		 402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.65 
 
 		 389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  32.67 
 
 		 370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5778  porin  33.43 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  33.52 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  32.51 
 
 		 362 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  33.24 
 
 		 383 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.49 
 
 		 358 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  34.66 
 
 		 387 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  33.74 
 
 		 389 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  33.96 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  34.48 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  33.51 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  33.81 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  31.7 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  31.76 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  35.26 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  34.06 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  34.26 
 
 		 383 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  32.12 
 
 		 371 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  32.35 
 
 		 368 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  29.4 
 
 		 392 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  29.4 
 
 		 392 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  33.13 
 
 		 390 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0333  outer membrane porin, putative  31.99 
 
 		 365 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277065  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  32.98 
 
 		 393 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  34.66 
 
 		 383 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  32.09 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  33.54 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  34.24 
 
 		 389 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  32.08 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  33.95 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  33.95 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  30.77 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  34.3 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  30.84 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  33.85 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  30.14 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  32.02 
 
 		 390 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  31.73 
 
 		 395 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  31.59 
 
 		 388 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  30.35 
 
 		 356 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  32.87 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  31.2 
 
 		 384 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  31.2 
 
 		 384 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  31.2 
 
 		 384 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  31.96 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  31.2 
 
 		 411 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  32.23 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  30.92 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  31.17 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  30.92 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  31.4 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  30.9 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  30.9 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  31.43 
 
 		 393 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  30.18 
 
 		 395 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  30.18 
 
 		 395 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  29.91 
 
 		 393 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  34.46 
 
 		 396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  31.73 
 
 		 386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  33.12 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  31.2 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  30.63 
 
 		 391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  32.54 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  33.06 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  31.73 
 
 		 386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  30.73 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>