More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7310 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7310  outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 369 aa  743    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  0.523788 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6767  outer membrane protein (porin)-like  72.55 
 
 		 370 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0380133  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  50.54 
 
 		 355 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  51.9 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  50.27 
 
 		 355 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  52.17 
 
 		 356 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  52.17 
 
 		 356 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  51.59 
 
 		 356 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2457  porin  46.8 
 
 		 359 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0201668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  45 
 
 		 359 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  44.74 
 
 		 361 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  44.75 
 
 		 359 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7462  outer membrane protein (porin)  42.9 
 
 		 360 aa  279  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00141122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5977  porin  41.19 
 
 		 363 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297374  decreased coverage  0.000158153 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5613  porin  41.19 
 
 		 363 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000212183  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  40.57 
 
 		 351 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4837  outer membrane protein, (porin)  34.16 
 
 		 374 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1582  porin  35.08 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0274  OmpC family outer membrane porin  35.41 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000878136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1601  porin  34.15 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32825  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6355  porin  32.45 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2327  putative outer membrane porin  33.33 
 
 		 376 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2036  putative outer membrane porin  33.33 
 
 		 375 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1346  putative outer membrane porin  33.33 
 
 		 376 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.80313  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1060  putative outer membrane porin  33.33 
 
 		 376 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3095  putative outer membrane porin  32.32 
 
 		 391 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1434  putative porin protein  33.63 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  31.55 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  30 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  30 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  33.43 
 
 		 385 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  33.43 
 
 		 385 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  30.75 
 
 		 358 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2000  porin Gram-negative type  32.19 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  32.28 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  33.05 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  29.84 
 
 		 355 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  31.57 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  31.31 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  31.61 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  31.31 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  31.7 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  33.52 
 
 		 395 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  31.32 
 
 		 363 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  30.79 
 
 		 383 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  40.37 
 
 		 394 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  33.84 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3269  porin  30.34 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00595502  normal  0.572597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  41.35 
 
 		 393 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  32.05 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  30.1 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  40.87 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  30.1 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  31.12 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  31.12 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  31.12 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  31.96 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  31.5 
 
 		 364 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5649  outer membrane protein (porin)  30.4 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5210  outer membrane protein (porin)  30.4 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00719172  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  31.04 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5230  outer membrane protein, (porin)  31.55 
 
 		 348 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  31.38 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  31.1 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  31.38 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  31.39 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  32.71 
 
 		 354 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  31.1 
 
 		 356 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  31.1 
 
 		 356 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  31.12 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  31.55 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  30.81 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3816  porin  34.11 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.386084  normal  0.290962 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  30 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  29.09 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  32.05 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  29.62 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  38.33 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  32.56 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  29.62 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  30 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  28.95 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  32.27 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  28.95 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  28.95 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  28.42 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  32.27 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  32.27 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  28.42 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  32.16 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  30.17 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  31.44 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  34.35 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  31.01 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  30.81 
 
 		 368 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  37.02 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  30.75 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  30.65 
 
 		 374 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  41.2 
 
 		 386 aa  110  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.49 
 
 		 367 aa  109  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>