More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2361 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 349 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  36.16 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  35.61 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  36.78 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  36.49 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  36.49 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  36.21 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0935  OmpC family outer membrane porin  33.25 
 
 		 372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000655737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  32.95 
 
 		 335 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  32.11 
 
 		 364 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  35.12 
 
 		 356 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  35.12 
 
 		 356 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  35.12 
 
 		 356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4118  porin Gram-negative type  30.99 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0545  OmpC family outer membrane porin  31.07 
 
 		 352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  34.91 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  32.3 
 
 		 355 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  32.15 
 
 		 355 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  32.3 
 
 		 355 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  31.89 
 
 		 351 aa  126  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  31.15 
 
 		 354 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  33.77 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  33.51 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  33.16 
 
 		 357 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  33.06 
 
 		 355 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  31.56 
 
 		 362 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  32.79 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  32.07 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  32.41 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  31.55 
 
 		 383 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  31.61 
 
 		 348 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  32.34 
 
 		 389 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  31.04 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  32.09 
 
 		 367 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  32.24 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  33.52 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  31.28 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  31.28 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5778  porin  31.18 
 
 		 358 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  31.99 
 
 		 383 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  32.24 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  32.24 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  31.23 
 
 		 385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  31.23 
 
 		 385 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  32.1 
 
 		 335 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  30.65 
 
 		 362 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  31.3 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.62 
 
 		 367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  30.73 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  30.58 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  32.11 
 
 		 379 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  31.27 
 
 		 359 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  33.44 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  31.18 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  32.84 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5977  porin  33.86 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297374  decreased coverage  0.000158153 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  31.02 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5613  porin  33.86 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000212183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  31.49 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  30.65 
 
 		 358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  31.99 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  33.43 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7462  outer membrane protein (porin)  32.24 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00141122  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  31.49 
 
 		 386 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  31.49 
 
 		 386 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  31.17 
 
 		 363 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  31.49 
 
 		 386 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  30.67 
 
 		 391 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  31.74 
 
 		 436 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  31.17 
 
 		 363 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  31.49 
 
 		 386 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  31.49 
 
 		 386 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  31.61 
 
 		 363 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  31.17 
 
 		 363 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  30.9 
 
 		 380 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3897  porin  31.35 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239452 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  32.21 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  32.76 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  27.87 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  31.03 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  31.25 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  31.12 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  31.94 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  31.99 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  30.89 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  31.05 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  31.09 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  31.09 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  30.69 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  33.02 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  30.42 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  33.02 
 
 		 380 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  31.01 
 
 		 375 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  29.78 
 
 		 344 aa  106  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  29.37 
 
 		 406 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  31.23 
 
 		 386 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  30.53 
 
 		 384 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  31.58 
 
 		 387 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  31.35 
 
 		 372 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  33.62 
 
 		 421 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>