More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5613 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_5977  porin  100 
 
 
363 aa  729    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297374  decreased coverage  0.000158153 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5613  porin  100 
 
 
363 aa  729    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000212183  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7462  outer membrane protein (porin)  79.94 
 
 
360 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00141122  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  56.34 
 
 
361 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  53.04 
 
 
355 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  52.76 
 
 
355 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  55.06 
 
 
356 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  48.76 
 
 
359 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  51.42 
 
 
356 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  51.42 
 
 
356 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  51.42 
 
 
356 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2457  porin  47.93 
 
 
359 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0201668  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  49.03 
 
 
359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7310  outer membrane protein (porin)  41.19 
 
 
369 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  0.523788 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6767  outer membrane protein (porin)-like  41.53 
 
 
370 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0380133  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  38.81 
 
 
351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0274  OmpC family outer membrane porin  37.82 
 
 
350 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000878136  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1582  porin  37.57 
 
 
374 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1601  porin  36.99 
 
 
374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32825  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4837  outer membrane protein, (porin)  35.26 
 
 
374 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00816794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  33.42 
 
 
389 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  34.01 
 
 
385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  33.75 
 
 
385 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2036  putative outer membrane porin  32.41 
 
 
375 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3095  putative outer membrane porin  32.41 
 
 
391 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  32.69 
 
 
356 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  34.52 
 
 
374 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1346  putative outer membrane porin  32.41 
 
 
376 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.80313  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2327  putative outer membrane porin  32.41 
 
 
376 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1060  putative outer membrane porin  32.41 
 
 
376 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1434  putative porin protein  32.41 
 
 
379 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  33.16 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  36.52 
 
 
394 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  33.85 
 
 
390 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  35.7 
 
 
377 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  34.63 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  34.63 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  32.42 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  32.42 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  32.42 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  34.63 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  36.95 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  34.4 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6355  porin  29.79 
 
 
398 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  34.77 
 
 
376 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  32.35 
 
 
386 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  32.35 
 
 
386 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  33.92 
 
 
383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  33.59 
 
 
393 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  33.78 
 
 
377 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  33.9 
 
 
390 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  36.95 
 
 
395 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  32.92 
 
 
408 aa  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  32.49 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  32.49 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  33.62 
 
 
390 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  33.08 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  32.24 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  35.33 
 
 
379 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  36.31 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  33.79 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.42 
 
 
358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  37.45 
 
 
389 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  37.45 
 
 
389 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  37.45 
 
 
389 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  34.76 
 
 
386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  34.76 
 
 
386 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  34.76 
 
 
436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  34.76 
 
 
386 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  34.76 
 
 
386 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  34.76 
 
 
386 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  34.43 
 
 
383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  34.76 
 
 
386 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  34.52 
 
 
353 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  31.93 
 
 
364 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  32.83 
 
 
380 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  33.25 
 
 
386 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  34.47 
 
 
436 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  32.92 
 
 
386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  33.51 
 
 
379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  33.51 
 
 
379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  35.48 
 
 
395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  32.82 
 
 
383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  35.01 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  32.27 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  34.51 
 
 
379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  34.77 
 
 
379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  35.58 
 
 
374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  30.94 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  32.92 
 
 
386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  34.51 
 
 
379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  33.25 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  33.08 
 
 
376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  33.08 
 
 
376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  32.15 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  34.51 
 
 
379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  32.92 
 
 
386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4878  porin  34.11 
 
 
382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311549  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  34.67 
 
 
380 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  33.97 
 
 
355 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>