More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1072 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0633  putative outer membrane porin  98.68 
 
 		 379 aa  748    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  100 
 
 		 379 aa  757    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1796  putative outer membrane porin  98.68 
 
 		 379 aa  748    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  100 
 
 		 379 aa  757    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0832  putative outer membrane porin  98.68 
 
 		 379 aa  748    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5460  porin  75.83 
 
 		 382 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.376591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0054  outer membrane protein (porin)  75.77 
 
 		 382 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.914863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4912  porin  76.11 
 
 		 382 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203081  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3218  porin  74.26 
 
 		 373 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.819696  normal  0.0778047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4597  porin  76.39 
 
 		 382 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000189593 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5632  porin  76.39 
 
 		 382 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0304788  decreased coverage  0.00129343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5227  porin  76.39 
 
 		 382 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143813  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  71.24 
 
 		 379 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  67.03 
 
 		 377 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0181  outer membrane protein (porin)  67.5 
 
 		 385 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6973  porin  63.44 
 
 		 376 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02151  porin signal peptide protein  58.87 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0416  outer membrane protein (porin)  47.97 
 
 		 364 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.441779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  49.44 
 
 		 364 aa  319  6e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5128  outer membrane protein (porin)  49.05 
 
 		 364 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3196  outer membrane protein (porin)  47.88 
 
 		 361 aa  316  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  46.44 
 
 		 365 aa  315  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4595  outer membrane protein (porin)  49.05 
 
 		 364 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2109  outer membrane protein (porin)  49.03 
 
 		 362 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4871  porin  47.61 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  45.16 
 
 		 363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  45.21 
 
 		 373 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  46.48 
 
 		 363 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1076  outer membrane protein (porin)  48.32 
 
 		 362 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441264  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  45.71 
 
 		 372 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1076  outer membrane protein (porin)  48.04 
 
 		 362 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0592135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  43.6 
 
 		 375 aa  292  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0265  porin  41.78 
 
 		 373 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0179073  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4539  porin  45.11 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3809  porin  45.86 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  43.82 
 
 		 372 aa  269  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4878  porin  42.2 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  39.74 
 
 		 368 aa  255  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  39.34 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  39.47 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  38.05 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  38.05 
 
 		 386 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  36.1 
 
 		 357 aa  192  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  37.37 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  37.29 
 
 		 354 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  37.29 
 
 		 354 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  37.7 
 
 		 353 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  35.37 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  34.92 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  36.81 
 
 		 374 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  38.48 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  34.5 
 
 		 358 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  35.9 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  35.22 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  34.47 
 
 		 352 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  36.41 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  34.83 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  36.98 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  34.83 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  36.62 
 
 		 401 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  35.46 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  33.16 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  35.31 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  35.61 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  34.29 
 
 		 363 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  34.29 
 
 		 363 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  34.29 
 
 		 363 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  35.26 
 
 		 376 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  34.29 
 
 		 363 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  34.29 
 
 		 363 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  36.73 
 
 		 386 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  36.73 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  34.55 
 
 		 449 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  36.73 
 
 		 386 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  32.34 
 
 		 387 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  34.28 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  35.75 
 
 		 386 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  34.92 
 
 		 368 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  32.99 
 
 		 361 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  35.75 
 
 		 386 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  36.52 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  32.09 
 
 		 363 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  35.44 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  33.85 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  33.77 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  31.46 
 
 		 368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  35.28 
 
 		 383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  33.72 
 
 		 392 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  33.72 
 
 		 392 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  33.09 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  32.32 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  32.12 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  35 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  33.84 
 
 		 384 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  33.99 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  34.94 
 
 		 376 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  33.67 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  33.6 
 
 		 354 aa  150  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  34.94 
 
 		 376 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  32.59 
 
 		 367 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>