More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1601 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1582  porin  98.13 
 
 		 374 aa  742    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4837  outer membrane protein, (porin)  90.11 
 
 		 374 aa  669    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816794 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1601  porin  100 
 
 		 374 aa  753    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32825  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2036  putative outer membrane porin  74.16 
 
 		 375 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3095  putative outer membrane porin  74.16 
 
 		 391 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1060  putative outer membrane porin  74.16 
 
 		 376 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1434  putative porin protein  74.16 
 
 		 379 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1346  putative outer membrane porin  74.16 
 
 		 376 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.80313  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2327  putative outer membrane porin  74.16 
 
 		 376 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6355  porin  65.07 
 
 		 398 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  39.27 
 
 		 351 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  36.34 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  36.34 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  34.81 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  36.07 
 
 		 356 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  34.34 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  34.29 
 
 		 355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  34.89 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5977  porin  36.91 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297374  decreased coverage  0.000158153 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5613  porin  36.91 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000212183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2457  porin  35 
 
 		 359 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0201668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7310  outer membrane protein (porin)  33.6 
 
 		 369 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  0.523788 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0274  OmpC family outer membrane porin  32.63 
 
 		 350 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000878136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  34.6 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2502  putative outer membrane protein (porin)  36.02 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506227  normal  0.418434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2108  putative outer membrane protein (porin)  36.02 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7462  outer membrane protein (porin)  33.33 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00141122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  32.96 
 
 		 359 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6767  outer membrane protein (porin)-like  31.28 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0380133  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6718  porin  34.55 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.457172 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6483  porin  34.55 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1592  putative outer membrane protein (porin)  32.05 
 
 		 383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0359  putative porin protein  32.7 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0373439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1354  porin  32.82 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786529 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  33.16 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  31.13 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  31.33 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  31.36 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.43 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  33.04 
 
 		 363 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  33.04 
 
 		 363 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  32.75 
 
 		 363 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  32.75 
 
 		 363 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  33.04 
 
 		 363 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  31.17 
 
 		 358 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  33.04 
 
 		 449 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  32.19 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  31.93 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  33.04 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  31.93 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  31.93 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0416  outer membrane protein (porin)  32.92 
 
 		 364 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.441779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0843  OmpC family outer membrane porin  30.07 
 
 		 375 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0712597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5230  outer membrane protein, (porin)  29.51 
 
 		 348 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  32.07 
 
 		 400 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  30.25 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  31.18 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  30.12 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  32.21 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  30.12 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  31.59 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2000  porin Gram-negative type  30.48 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  29.6 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5128  outer membrane protein (porin)  32.19 
 
 		 364 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  28.85 
 
 		 379 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  31.82 
 
 		 357 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  30.46 
 
 		 363 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  30.67 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  31.68 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  30.73 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  30.53 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.11 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4595  outer membrane protein (porin)  32.67 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  31.78 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  31.78 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  30.31 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  32.02 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  31.54 
 
 		 376 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  30.85 
 
 		 335 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  31.03 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  31.15 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  30.28 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  30.28 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0633  putative outer membrane porin  29.7 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  29.16 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  29.75 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  29.16 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  31.15 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1796  putative outer membrane porin  29.7 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0832  putative outer membrane porin  29.7 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  30.34 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2974  outer membrane porin  31.15 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.598026  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  31.57 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6216  porin  27.76 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  30.3 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  29.68 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  31.58 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  30.3 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  32.49 
 
 		 359 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4871  porin  30.29 
 
 		 371 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000247804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>