More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4265 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4265  porin Gram-negative type  100 
 
 		 348 aa  708    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.505475 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5230  outer membrane protein, (porin)  48.33 
 
 		 348 aa  316  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2332  outer membrane porin  47.53 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1343  porin  46.75 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2113  porin  47.11 
 
 		 420 aa  298  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1917  porin  46.91 
 
 		 347 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2489  outer membrane porin  46.91 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2373  outer membrane porin  46.91 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1473  outer membrane porin, putative  46.6 
 
 		 355 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288527  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3339  porin  46.6 
 
 		 355 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.205333  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1966  porin  46.6 
 
 		 355 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1240  porin  46.6 
 
 		 355 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1952  porin  46.25 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0650784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1929  porin  45.82 
 
 		 348 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202601  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6150  porin  45.82 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939145  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  36.84 
 
 		 373 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  34.25 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  33.24 
 
 		 374 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  33.43 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  33.06 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  33.06 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  33.15 
 
 		 352 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  33.33 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  34.08 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  32.98 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  33.14 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  33.83 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  31.59 
 
 		 367 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  31.12 
 
 		 386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  34.58 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  32.74 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  32.2 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  31.12 
 
 		 386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  34.34 
 
 		 354 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  33.04 
 
 		 352 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.56 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  35 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  32.77 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  35 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  35 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.68 
 
 		 358 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  32.91 
 
 		 355 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  33.52 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  30.87 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  31.12 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  35.97 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  32.59 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  31.89 
 
 		 368 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  33.33 
 
 		 436 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  33.33 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  33.33 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  33.33 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  33.33 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  33.33 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  31.27 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  33.6 
 
 		 384 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  31.46 
 
 		 361 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  33.77 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  33.07 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  33.07 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  33.93 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  36.32 
 
 		 386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  33.07 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  33.07 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  33.86 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  33.07 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  33.08 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  33.08 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  29.68 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  31.42 
 
 		 362 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  31.64 
 
 		 351 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  31.85 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  32.54 
 
 		 354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  32.54 
 
 		 354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  29.07 
 
 		 392 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  35.11 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  29.07 
 
 		 392 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  34.28 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  31.2 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  34.02 
 
 		 385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  30.48 
 
 		 380 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  30.77 
 
 		 350 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  29.83 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  34.02 
 
 		 383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  31.23 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  31.12 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  31.23 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  32.22 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6718  porin  32.56 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.457172 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6483  porin  32.56 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  31.38 
 
 		 383 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  31.69 
 
 		 364 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3347  porin Gram-negative type  29.75 
 
 		 348 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3000  porin Gram-negative type  30.79 
 
 		 348 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  31.23 
 
 		 383 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  31.23 
 
 		 383 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  31.27 
 
 		 383 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  32.66 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  30.77 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  30.28 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>