More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3097 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3097  porin  100 
 
 		 402 aa  803    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  67.08 
 
 		 401 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  55.96 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  59.75 
 
 		 374 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  55.87 
 
 		 368 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  57.14 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  53.18 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  57.14 
 
 		 379 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  55.34 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  55.34 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  57.83 
 
 		 368 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  53 
 
 		 355 aa  356  5e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  52.34 
 
 		 355 aa  356  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  53 
 
 		 355 aa  356  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  51.16 
 
 		 362 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  49.74 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  50.91 
 
 		 354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  50.66 
 
 		 355 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  50.27 
 
 		 383 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  49.18 
 
 		 353 aa  325  6e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  46.45 
 
 		 367 aa  316  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  45.07 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  45.97 
 
 		 383 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  48.09 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  43.63 
 
 		 383 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  43.63 
 
 		 383 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  43.63 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  46.43 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  43.41 
 
 		 377 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  43.21 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  43.21 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  42.08 
 
 		 387 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  42.37 
 
 		 398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  40.69 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2990  porin  43.6 
 
 		 387 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0177619  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  44.2 
 
 		 351 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1599  putative outer membrane porin signal peptide protein  42.05 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102431  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  40.83 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  41.22 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  42.28 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  39.67 
 
 		 392 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  39.67 
 
 		 392 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  40.87 
 
 		 449 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  42.78 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  42.78 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  41.28 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  42.78 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  42.78 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  42.78 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  39.14 
 
 		 389 aa  239  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  42.29 
 
 		 353 aa  239  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01789  porin protein  43.29 
 
 		 273 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  40.4 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  38.96 
 
 		 358 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  41.03 
 
 		 388 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  41.22 
 
 		 391 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  41.49 
 
 		 363 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  41.94 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  39.59 
 
 		 363 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  41.26 
 
 		 392 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5288  outer membrane porin  40.05 
 
 		 386 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  39.79 
 
 		 363 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  39.73 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  40 
 
 		 363 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  40 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  40 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4547  outer membrane porin signal peptide protein  38.74 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000157102  normal  0.308815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5712  porin  41.79 
 
 		 378 aa  206  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  38.92 
 
 		 350 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4800  porin  38.69 
 
 		 367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  38.32 
 
 		 379 aa  200  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3144  porin  40.06 
 
 		 362 aa  199  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3860  putative outer membrane porin signal peptide protein  39.35 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.087708  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  38.46 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3196  outer membrane protein (porin)  38.8 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  38.04 
 
 		 378 aa  189  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  38.54 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  38.54 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  38.58 
 
 		 377 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  38.58 
 
 		 377 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  38.58 
 
 		 377 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  38.58 
 
 		 377 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  38.29 
 
 		 377 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  35.62 
 
 		 373 aa  186  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  36.48 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  36.15 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  36.15 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  36.15 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  36.22 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5504  outer membrane porin  35.18 
 
 		 379 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  38.1 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  38.1 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  36.22 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  38.54 
 
 		 365 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  38.44 
 
 		 403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2607  OmpC family outer membrane porin  37.15 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.782547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  36.36 
 
 		 413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5460  porin  38.44 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.376591 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  39.69 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4912  porin  38.17 
 
 		 382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203081  normal  0.725846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>