More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0698 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 351 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0274  OmpC family outer membrane porin  56.16 
 
 		 350 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000878136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  43.7 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  42.08 
 
 		 356 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  42.08 
 
 		 356 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  41.87 
 
 		 355 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  41.53 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  42.15 
 
 		 355 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  42.73 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  38.67 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  39.34 
 
 		 359 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5977  porin  39.31 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297374  decreased coverage  0.000158153 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5613  porin  39.31 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000212183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2457  porin  39.07 
 
 		 359 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0201668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7462  outer membrane protein (porin)  38.37 
 
 		 360 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00141122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4837  outer membrane protein, (porin)  40.82 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1582  porin  40.61 
 
 		 374 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1601  porin  39.67 
 
 		 374 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32825  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7310  outer membrane protein (porin)  40.57 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  0.523788 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6767  outer membrane protein (porin)-like  35.93 
 
 		 370 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0380133  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  34.17 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3095  putative outer membrane porin  34.79 
 
 		 391 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1060  putative outer membrane porin  33.8 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2036  putative outer membrane porin  33.8 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1434  putative porin protein  33.8 
 
 		 379 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1346  putative outer membrane porin  33.8 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.80313  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2327  putative outer membrane porin  33.8 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  31.15 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  31.23 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  31.23 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  32.67 
 
 		 363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6355  porin  33.6 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  32.1 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  32.1 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  32.1 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  32.1 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  32.1 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  32.1 
 
 		 449 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  33.52 
 
 		 355 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  32.14 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.68 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  35.38 
 
 		 384 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  30.93 
 
 		 379 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  30.93 
 
 		 379 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  35.64 
 
 		 384 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  33.43 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  33.58 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  33.33 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  32.65 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  34.7 
 
 		 383 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1717  OmpC family outer membrane porin  36.56 
 
 		 352 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  31.82 
 
 		 363 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0633  putative outer membrane porin  30.67 
 
 		 379 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0832  putative outer membrane porin  30.67 
 
 		 379 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1796  putative outer membrane porin  30.67 
 
 		 379 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  32.75 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  33.52 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  33.52 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  33.52 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  35.97 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  32.14 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  31.71 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  30.88 
 
 		 363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  32.83 
 
 		 387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  33.43 
 
 		 351 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4265  porin Gram-negative type  31.64 
 
 		 348 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.505475 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  32.37 
 
 		 354 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  32.37 
 
 		 354 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  31.14 
 
 		 386 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  31.97 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  31.92 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  31.92 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  31.14 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  31.97 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  32.08 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  32.98 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  33.59 
 
 		 368 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  31.71 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  31.57 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  31.31 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  31.57 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  30.37 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  29.32 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  32.59 
 
 		 363 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  33 
 
 		 383 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  30.79 
 
 		 379 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  32.75 
 
 		 386 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  32.75 
 
 		 386 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  32.75 
 
 		 386 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  32.75 
 
 		 386 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  32.75 
 
 		 386 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  32.75 
 
 		 386 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  31.61 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  32.75 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  31.88 
 
 		 376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  32.51 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6483  porin  32.33 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6718  porin  32.33 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.457172 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  33 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  34.18 
 
 		 391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>