More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4019 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  100 
 
 		 379 aa  765    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  71.24 
 
 		 379 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  71.24 
 
 		 379 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5460  porin  75 
 
 		 382 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.376591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4912  porin  74.72 
 
 		 382 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203081  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0054  outer membrane protein (porin)  74.3 
 
 		 382 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.914863  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0633  putative outer membrane porin  71.5 
 
 		 379 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0832  putative outer membrane porin  71.5 
 
 		 379 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4597  porin  76.39 
 
 		 382 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000189593 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5632  porin  76.39 
 
 		 382 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0304788  decreased coverage  0.00129343 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1796  putative outer membrane porin  71.5 
 
 		 379 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5227  porin  76.39 
 
 		 382 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143813  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3218  porin  71.05 
 
 		 373 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.819696  normal  0.0778047 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0181  outer membrane protein (porin)  70.68 
 
 		 385 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  66.04 
 
 		 377 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6973  porin  61.71 
 
 		 376 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02151  porin signal peptide protein  59.44 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  46.58 
 
 		 373 aa  334  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  48.03 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4871  porin  49.01 
 
 		 371 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  46.9 
 
 		 363 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  45.99 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  45.79 
 
 		 375 aa  322  8e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  45.92 
 
 		 363 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3196  outer membrane protein (porin)  46.58 
 
 		 361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3809  porin  47.65 
 
 		 392 aa  305  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2109  outer membrane protein (porin)  47.66 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0265  porin  43.31 
 
 		 373 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0179073  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  46.35 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0416  outer membrane protein (porin)  46.22 
 
 		 364 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.441779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4595  outer membrane protein (porin)  46.88 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1076  outer membrane protein (porin)  46.93 
 
 		 362 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441264  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5128  outer membrane protein (porin)  46.61 
 
 		 364 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1076  outer membrane protein (porin)  46.93 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0592135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4539  porin  44.66 
 
 		 382 aa  289  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  41.32 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  43.16 
 
 		 372 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4878  porin  42.82 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  41.27 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  39.1 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  41.05 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  41.05 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  38.22 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  37.17 
 
 		 377 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  38.21 
 
 		 353 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  36.01 
 
 		 367 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  37.17 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  38.7 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  37.14 
 
 		 355 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  36.2 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  35.99 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  38.38 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  35.99 
 
 		 386 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  38.96 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  35.53 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  34.84 
 
 		 389 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  36.57 
 
 		 383 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  36.66 
 
 		 358 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  34.81 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  34.71 
 
 		 356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  34.74 
 
 		 371 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  34.27 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  35.85 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  35.85 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  34 
 
 		 367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  35.52 
 
 		 383 aa  163  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  36.5 
 
 		 384 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  35.97 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  33.76 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  34.1 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  34.86 
 
 		 384 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  34.1 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  34.1 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  34.93 
 
 		 385 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  34.25 
 
 		 352 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  34.69 
 
 		 385 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  35.35 
 
 		 383 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  35.35 
 
 		 383 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  31.42 
 
 		 358 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  35.37 
 
 		 387 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  34.1 
 
 		 449 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  34.1 
 
 		 363 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  34.1 
 
 		 363 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  34.06 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  34.95 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  35.86 
 
 		 374 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  35.77 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  34.91 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  34.3 
 
 		 368 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  34.02 
 
 		 363 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  35.5 
 
 		 376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  35.5 
 
 		 376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  32.56 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  34.04 
 
 		 353 aa  156  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  35.73 
 
 		 387 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  35.61 
 
 		 376 aa  155  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  35.7 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  35.04 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  34.39 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  33.41 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>