More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4878 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4878  porin  100 
 
 		 382 aa  770    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  48.34 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  48 
 
 		 372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4871  porin  47.56 
 
 		 371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  47.25 
 
 		 365 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  46.28 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  46.01 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  46.86 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0416  outer membrane protein (porin)  47.14 
 
 		 364 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.441779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  45.27 
 
 		 363 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  44.62 
 
 		 372 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5128  outer membrane protein (porin)  47.14 
 
 		 364 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  44.02 
 
 		 375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4595  outer membrane protein (porin)  47.68 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0265  porin  44 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0179073  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3196  outer membrane protein (porin)  43.41 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3809  porin  43.79 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4539  porin  43.68 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02151  porin signal peptide protein  44.94 
 
 		 374 aa  272  9e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5460  porin  43.13 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.376591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0054  outer membrane protein (porin)  42.7 
 
 		 382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.914863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4912  porin  42.86 
 
 		 382 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203081  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  42.2 
 
 		 379 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  42.2 
 
 		 379 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  41.92 
 
 		 377 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2109  outer membrane protein (porin)  43.63 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3218  porin  41.38 
 
 		 373 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.819696  normal  0.0778047 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6973  porin  43.49 
 
 		 376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1076  outer membrane protein (porin)  43.71 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0592135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4597  porin  42.03 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000189593 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5632  porin  42.03 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0304788  decreased coverage  0.00129343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5227  porin  42.03 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143813  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0633  putative outer membrane porin  41.94 
 
 		 379 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0832  putative outer membrane porin  41.94 
 
 		 379 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1796  putative outer membrane porin  41.94 
 
 		 379 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  42.29 
 
 		 379 aa  255  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1076  outer membrane protein (porin)  43.14 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441264  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0181  outer membrane protein (porin)  40.21 
 
 		 385 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  41.55 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  37.84 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  39.13 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  39.13 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  37.07 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  39.39 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  36.58 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  38.55 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  35.64 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  35.98 
 
 		 356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  37.25 
 
 		 355 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  35.58 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  34.99 
 
 		 357 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  34.91 
 
 		 386 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  34.65 
 
 		 386 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  33.51 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  35.77 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  35.85 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  35.92 
 
 		 401 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  32.28 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  32.28 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  34.48 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  34.05 
 
 		 379 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  35.31 
 
 		 354 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  35.31 
 
 		 354 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  35.31 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  34.43 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  33.42 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.8 
 
 		 389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2990  porin  36.05 
 
 		 387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0177619  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  33.69 
 
 		 363 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  33.75 
 
 		 388 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  33.69 
 
 		 363 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  33.69 
 
 		 363 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  33.95 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  33.69 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  32.01 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  33.69 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  33.51 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  34.51 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  34.88 
 
 		 368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  33.97 
 
 		 379 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  34.82 
 
 		 358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  35.75 
 
 		 376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  36.06 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1599  putative outer membrane porin signal peptide protein  35.41 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  36.5 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  36.5 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  35.66 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  35.66 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  36.5 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  32.36 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  32.05 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  35.66 
 
 		 386 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  32.72 
 
 		 383 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  30.33 
 
 		 363 aa  143  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5288  outer membrane porin  34.2 
 
 		 386 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  33.69 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  32.8 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  35.1 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  32.8 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  31.99 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>