More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0054 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4912  porin  95.29 
 
 		 382 aa  707    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203081  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0054  outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 382 aa  766    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.914863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5460  porin  95.03 
 
 		 382 aa  706    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.376591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4597  porin  94.24 
 
 		 382 aa  677    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000189593 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5632  porin  94.24 
 
 		 382 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0304788  decreased coverage  0.00129343 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3218  porin  92.78 
 
 		 373 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.819696  normal  0.0778047 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5227  porin  94.24 
 
 		 382 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143813  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  74.87 
 
 		 379 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  74.87 
 
 		 379 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0633  putative outer membrane porin  75.13 
 
 		 379 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0832  putative outer membrane porin  75.13 
 
 		 379 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1796  putative outer membrane porin  75.13 
 
 		 379 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  72.73 
 
 		 379 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0181  outer membrane protein (porin)  68.33 
 
 		 385 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  66.49 
 
 		 377 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6973  porin  62.57 
 
 		 376 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02151  porin signal peptide protein  58.03 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  47.01 
 
 		 365 aa  332  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4871  porin  50.42 
 
 		 371 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  46.95 
 
 		 363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  49.16 
 
 		 364 aa  326  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3196  outer membrane protein (porin)  48.04 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0416  outer membrane protein (porin)  49.22 
 
 		 364 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.441779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  46.54 
 
 		 375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  44.91 
 
 		 373 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  46.2 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5128  outer membrane protein (porin)  49.74 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4595  outer membrane protein (porin)  49.22 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2109  outer membrane protein (porin)  47.93 
 
 		 362 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  49.44 
 
 		 372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0265  porin  43.26 
 
 		 373 aa  292  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0179073  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  45.9 
 
 		 372 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4539  porin  45.78 
 
 		 382 aa  285  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3809  porin  45.3 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1076  outer membrane protein (porin)  46.09 
 
 		 362 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1076  outer membrane protein (porin)  46.09 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0592135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4878  porin  42.86 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  39.83 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  38.62 
 
 		 354 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  38.78 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  35.43 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  37.19 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  37.28 
 
 		 355 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  37.5 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  36.29 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  33.42 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  34.04 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  39.84 
 
 		 401 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  35.91 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  36.27 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  35.91 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  35.55 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  36.36 
 
 		 383 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  35.55 
 
 		 386 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  36.03 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  34.26 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  34.56 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  34.56 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  34.84 
 
 		 353 aa  162  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  34.72 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  35.9 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  33.76 
 
 		 371 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  35.66 
 
 		 383 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  33.77 
 
 		 374 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  35.66 
 
 		 383 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  37.28 
 
 		 384 aa  159  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  35.68 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  35.66 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  32.79 
 
 		 352 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  33.33 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  33.33 
 
 		 362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  34.39 
 
 		 363 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  34.39 
 
 		 363 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  34.39 
 
 		 363 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  34.39 
 
 		 363 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  34.39 
 
 		 363 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  33.67 
 
 		 398 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  34.66 
 
 		 449 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  34.74 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  34.3 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  33.59 
 
 		 363 aa  154  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  31.82 
 
 		 363 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  34.65 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  31.44 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  32.74 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  31.85 
 
 		 378 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  34.59 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  34.59 
 
 		 376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  35.43 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  33.75 
 
 		 383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  30.94 
 
 		 377 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  30.94 
 
 		 377 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  32.79 
 
 		 392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2607  OmpC family outer membrane porin  33.6 
 
 		 363 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.782547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  30.94 
 
 		 377 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  32.81 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  31.13 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  31.13 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  31.13 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  30.94 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>