More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4597 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4597  porin  100 
 
 		 382 aa  767    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000189593 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5227  porin  100 
 
 		 382 aa  767    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143813  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3218  porin  90.11 
 
 		 373 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.819696  normal  0.0778047 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0054  outer membrane protein (porin)  94.24 
 
 		 382 aa  699    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.914863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5460  porin  96.34 
 
 		 382 aa  714    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.376591 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5632  porin  100 
 
 		 382 aa  767    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0304788  decreased coverage  0.00129343 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4912  porin  96.6 
 
 		 382 aa  715    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203081  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  75.67 
 
 		 379 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  75.67 
 
 		 379 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0633  putative outer membrane porin  76.2 
 
 		 379 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1796  putative outer membrane porin  76.2 
 
 		 379 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0832  putative outer membrane porin  76.2 
 
 		 379 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  75.13 
 
 		 379 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0181  outer membrane protein (porin)  67.92 
 
 		 385 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  66.49 
 
 		 377 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6973  porin  64.17 
 
 		 376 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02151  porin signal peptide protein  59.15 
 
 		 374 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3196  outer membrane protein (porin)  49.35 
 
 		 361 aa  332  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4871  porin  50.42 
 
 		 371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  47.73 
 
 		 363 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  46.47 
 
 		 365 aa  322  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  48.6 
 
 		 364 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0416  outer membrane protein (porin)  49.61 
 
 		 364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.441779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2109  outer membrane protein (porin)  49.86 
 
 		 362 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  46.4 
 
 		 375 aa  317  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  46.63 
 
 		 373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5128  outer membrane protein (porin)  49.74 
 
 		 364 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  46.48 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4595  outer membrane protein (porin)  49.48 
 
 		 364 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  48.88 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0265  porin  44.59 
 
 		 373 aa  296  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0179073  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1076  outer membrane protein (porin)  47.77 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1076  outer membrane protein (porin)  47.77 
 
 		 362 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0592135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4539  porin  46.77 
 
 		 382 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  46.7 
 
 		 372 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3809  porin  45.86 
 
 		 392 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4878  porin  42.48 
 
 		 382 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  41.08 
 
 		 368 aa  259  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  36.43 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  38.1 
 
 		 354 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  37.85 
 
 		 351 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  38.1 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  39.47 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  36.69 
 
 		 355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  36.57 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  37.2 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  34.03 
 
 		 377 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  35.42 
 
 		 353 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  36.81 
 
 		 354 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  36.81 
 
 		 354 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  34.13 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  36.13 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  35.6 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  35.6 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  35.29 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  35.09 
 
 		 383 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  35.29 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  36.3 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  34.16 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  34.84 
 
 		 353 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  33.61 
 
 		 352 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  34.55 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  35 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  33.76 
 
 		 371 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  35 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  34.76 
 
 		 383 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  34.92 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  35 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  34.92 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  34.92 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  33.77 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  34.92 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  34.92 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  35.99 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  33.92 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  35.19 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  33.08 
 
 		 358 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  32.66 
 
 		 362 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  33.95 
 
 		 379 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  34.28 
 
 		 376 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  34.28 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  33.67 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  34.22 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  31.99 
 
 		 363 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  33.6 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  35.53 
 
 		 388 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  34.12 
 
 		 357 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  31.44 
 
 		 379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  33.51 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  33.91 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  33.42 
 
 		 354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2607  OmpC family outer membrane porin  33.6 
 
 		 363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.782547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  32.39 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  36.01 
 
 		 380 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  31.72 
 
 		 378 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  35.59 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  31.86 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  31.86 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  31.86 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  34.83 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>