More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1728 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  94.21 
 
 		 363 aa  700    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  94.21 
 
 		 363 aa  700    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  94.49 
 
 		 363 aa  703    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  94.49 
 
 		 363 aa  703    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  94.21 
 
 		 449 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  94.21 
 
 		 363 aa  700    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  100 
 
 		 363 aa  739    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  82.09 
 
 		 363 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  82.09 
 
 		 363 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  79.06 
 
 		 363 aa  598  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  80.72 
 
 		 363 aa  594  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  84.98 
 
 		 392 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  80.72 
 
 		 363 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  80.72 
 
 		 363 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  74.64 
 
 		 358 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  65.75 
 
 		 361 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  65.52 
 
 		 354 aa  464  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  67.87 
 
 		 353 aa  448  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  61.22 
 
 		 367 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  40.88 
 
 		 355 aa  222  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  41.07 
 
 		 402 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  41.57 
 
 		 355 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  41.57 
 
 		 355 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  39.5 
 
 		 355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  36.97 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  38.5 
 
 		 383 aa  205  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  37.02 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  37.02 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  36.76 
 
 		 383 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  38.46 
 
 		 386 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  38.8 
 
 		 383 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  37.47 
 
 		 383 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  36.61 
 
 		 379 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  39.27 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  40.67 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  37.2 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  38.2 
 
 		 386 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  40.36 
 
 		 374 aa  198  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  40.44 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  36.39 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  34.41 
 
 		 371 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  42.3 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  36.77 
 
 		 389 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  38.03 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  34.75 
 
 		 392 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  34.75 
 
 		 392 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  38.98 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  35.71 
 
 		 356 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  35.45 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  36.99 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  36.99 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  36.44 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2607  OmpC family outer membrane porin  35.85 
 
 		 363 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.782547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  35.75 
 
 		 377 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  35.82 
 
 		 351 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  34.23 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  35.92 
 
 		 401 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  35.59 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3196  outer membrane protein (porin)  36.68 
 
 		 361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  33.75 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  32.36 
 
 		 398 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  34.07 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  34.07 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  34.07 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  34.07 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  34.07 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  34.07 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  33.74 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  34.07 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  34.69 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  34.34 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  34.33 
 
 		 387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  33.67 
 
 		 391 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  33.7 
 
 		 357 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1599  putative outer membrane porin signal peptide protein  34.01 
 
 		 386 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102431  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  33.66 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  35.62 
 
 		 354 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  34.41 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  34.64 
 
 		 373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2990  porin  34.33 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0177619  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  33.77 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  34.17 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  34.17 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  34.43 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  33.77 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  34.17 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4800  porin  33.33 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6483  porin  35 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2109  outer membrane protein (porin)  34.46 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6718  porin  35 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.457172 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  33.42 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  33.96 
 
 		 373 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  34.25 
 
 		 372 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0633  putative outer membrane porin  33.25 
 
 		 379 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0832  putative outer membrane porin  33.25 
 
 		 379 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1796  putative outer membrane porin  33.25 
 
 		 379 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0416  outer membrane protein (porin)  35.28 
 
 		 364 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.441779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  33.77 
 
 		 413 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  37.29 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4878  porin  33.51 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>