More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A3014 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  100 
 
 
377 aa  760    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  100 
 
 
377 aa  760    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  100 
 
 
377 aa  760    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  99.47 
 
 
377 aa  756    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  99.2 
 
 
377 aa  754    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  100 
 
 
377 aa  760    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  99.47 
 
 
377 aa  756    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  96.03 
 
 
378 aa  736    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  76.66 
 
 
373 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  76.66 
 
 
373 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  76.66 
 
 
373 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  74.46 
 
 
379 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  76.39 
 
 
373 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  75.33 
 
 
384 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  75.86 
 
 
384 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  76.66 
 
 
373 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  72.61 
 
 
413 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  47.88 
 
 
360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  45.18 
 
 
357 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  42.49 
 
 
363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  46.01 
 
 
354 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  46.01 
 
 
357 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2974  outer membrane porin  46.01 
 
 
354 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.598026  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  40.41 
 
 
382 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  43.12 
 
 
376 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  43.12 
 
 
376 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  42.2 
 
 
376 aa  246  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5535  porin Gram-negative type  36.98 
 
 
391 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.438233 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  37.53 
 
 
379 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  35.92 
 
 
368 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  37.76 
 
 
355 aa  189  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  36.02 
 
 
362 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  37.4 
 
 
355 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  35.84 
 
 
354 aa  186  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  36.06 
 
 
355 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  36.06 
 
 
355 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  35.48 
 
 
352 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  35.88 
 
 
374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  38.36 
 
 
402 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  35.32 
 
 
368 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  34.76 
 
 
379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  34.43 
 
 
371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  35.6 
 
 
367 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  33.42 
 
 
386 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  34.82 
 
 
401 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  36.31 
 
 
356 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  33.42 
 
 
386 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  34.07 
 
 
363 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  33.41 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  34.32 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  34.48 
 
 
363 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  34.48 
 
 
363 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  34.48 
 
 
363 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  34.48 
 
 
363 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  34.48 
 
 
363 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  35.05 
 
 
353 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  31.7 
 
 
392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  31.7 
 
 
392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0029  porin  40.79 
 
 
264 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  33.33 
 
 
393 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  32.98 
 
 
383 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  32.98 
 
 
383 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  33.68 
 
 
365 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5539  porin  32.35 
 
 
386 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  34.58 
 
 
352 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  33.07 
 
 
347 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  32.72 
 
 
383 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  34.87 
 
 
387 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0350  OmpC family outer membrane porin  32.65 
 
 
372 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000145681  hitchhiker  0.00000929748 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  32.24 
 
 
383 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  30.6 
 
 
389 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  34.13 
 
 
358 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4800  porin  33.25 
 
 
367 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  32.26 
 
 
357 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5712  porin  34 
 
 
378 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4547  outer membrane porin signal peptide protein  33.01 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000157102  normal  0.308815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  31.28 
 
 
398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4171  porin  33.59 
 
 
381 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315389  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2320  outer membrane protein (porin)-like  32.64 
 
 
381 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  31.25 
 
 
383 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1599  putative outer membrane porin signal peptide protein  33.17 
 
 
386 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102431  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  33.33 
 
 
351 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2990  porin  32.49 
 
 
387 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0177619  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5288  outer membrane porin  31.97 
 
 
386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3347  porin Gram-negative type  32.1 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.33 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3000  porin Gram-negative type  32.36 
 
 
348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  30.98 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  33.33 
 
 
377 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  32.61 
 
 
388 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  33.98 
 
 
379 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4994  porin  34.97 
 
 
381 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.211824  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  33.58 
 
 
357 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  32.42 
 
 
368 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2538  porin  33.77 
 
 
382 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.47604 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  34.02 
 
 
363 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1717  OmpC family outer membrane porin  34.14 
 
 
352 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  33.93 
 
 
363 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  35.19 
 
 
363 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  34.12 
 
 
392 aa  142  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>