More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1190 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
359 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  63.77 
 
 
356 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  61.27 
 
 
355 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  61.61 
 
 
359 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2457  porin  58.61 
 
 
359 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0201668  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  61.27 
 
 
355 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  60.22 
 
 
361 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  56.46 
 
 
356 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  56.46 
 
 
356 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  56.18 
 
 
356 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5977  porin  50.3 
 
 
363 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297374  decreased coverage  0.000158153 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5613  porin  50.3 
 
 
363 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000212183  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7462  outer membrane protein (porin)  49.55 
 
 
360 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00141122  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6767  outer membrane protein (porin)-like  47.43 
 
 
370 aa  315  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0380133  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7310  outer membrane protein (porin)  45 
 
 
369 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  0.523788 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  42.73 
 
 
351 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0274  OmpC family outer membrane porin  42.65 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000878136  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  34.32 
 
 
358 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  32.26 
 
 
361 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  36.39 
 
 
355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4837  outer membrane protein, (porin)  34.34 
 
 
374 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00816794 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6355  porin  33.33 
 
 
398 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1582  porin  33.87 
 
 
374 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1601  porin  34.6 
 
 
374 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32825  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  32.69 
 
 
363 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  32.22 
 
 
363 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  32.22 
 
 
363 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  32.69 
 
 
449 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  32.69 
 
 
363 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  32.22 
 
 
363 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  35.29 
 
 
355 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  35.29 
 
 
355 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  33.7 
 
 
363 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  32.96 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  32.24 
 
 
354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  34.06 
 
 
355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  33.14 
 
 
363 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  32.24 
 
 
367 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  33.82 
 
 
353 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  32.75 
 
 
392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5230  outer membrane protein, (porin)  34.02 
 
 
348 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  34.52 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  35.18 
 
 
353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  31.59 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  32.17 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  34.5 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1434  putative porin protein  31.68 
 
 
379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2036  putative outer membrane porin  31.68 
 
 
375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2327  putative outer membrane porin  31.68 
 
 
376 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  32.78 
 
 
350 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1346  putative outer membrane porin  31.68 
 
 
376 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.80313  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1060  putative outer membrane porin  31.68 
 
 
376 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3095  putative outer membrane porin  31.68 
 
 
391 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  31.01 
 
 
363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1917  porin  32.94 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  31.01 
 
 
363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  32.72 
 
 
371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  33.33 
 
 
374 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  33.83 
 
 
390 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  32.82 
 
 
368 aa  126  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  33.16 
 
 
375 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5219  porin  35.42 
 
 
362 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10924  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  33.25 
 
 
390 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  34.49 
 
 
367 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  32.59 
 
 
430 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  31.91 
 
 
379 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  33.04 
 
 
373 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  31.91 
 
 
379 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  32.59 
 
 
430 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  32.59 
 
 
430 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  32.01 
 
 
402 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  32.3 
 
 
362 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  32.3 
 
 
362 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  32.34 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  32.34 
 
 
430 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  32.22 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  32.34 
 
 
430 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  32.34 
 
 
430 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  32.22 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  32.3 
 
 
362 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  30.1 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3381  porin  34.95 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.573075  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  32.97 
 
 
401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  34.86 
 
 
380 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  33.82 
 
 
351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  38.82 
 
 
395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  33.81 
 
 
380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  33.8 
 
 
353 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  34.81 
 
 
368 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  30.65 
 
 
378 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  34.15 
 
 
357 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1796  putative outer membrane porin  31.22 
 
 
379 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0832  putative outer membrane porin  31.22 
 
 
379 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0633  putative outer membrane porin  31.22 
 
 
379 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3435  porin  33.04 
 
 
362 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4082  porin  34.17 
 
 
362 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820071  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  34.62 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2734  outer membrane protein (porin)  34.48 
 
 
362 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00626959  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  31.89 
 
 
375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  32.81 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>