More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2933 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2933  porin  100 
 
 		 365 aa  726    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1174  porin  63.56 
 
 		 363 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1236  outer membrane porin lipoprotein transmembrane  61.24 
 
 		 369 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  47.89 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  46.61 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2314  porin  45.81 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  42.01 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2760  putative porin signal peptide protein  42.69 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102409  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2136  porin signal peptide protein  42.01 
 
 		 352 aa  235  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1412  porin  36.12 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170387  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3975  porin  37.85 
 
 		 369 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0863036  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4439  porin  37.85 
 
 		 369 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.989602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2592  outer membrane porin protein  36.12 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1352  outer membrane porin  36.12 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0561388  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1437  outer membrane porin  36.12 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1242  putative outer membrane porin  35.85 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1086  putative outer membrane porin  35.85 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0213  putative outer membrane porin  35.85 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0486  putative outer membrane porin  35.85 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.278408  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5754  porin  38.03 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4097  porin  37.01 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4550  porin  38.03 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.537681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1296  outer membrane protein (porin)  37.46 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0843  OmpC family outer membrane porin  36.66 
 
 		 375 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0712597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  35.85 
 
 		 370 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3818  porin  37.36 
 
 		 369 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5737  outer membrane protein (porin)-like  39.2 
 
 		 359 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0160198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  36.24 
 
 		 361 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0880  outer membrane protein (porin)-like protein  38.46 
 
 		 360 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2320  outer membrane protein (porin)-like protein  37.43 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0798185  normal  0.76892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2455  outer membrane protein (porin)-like protein  37.61 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00019464  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6806  OmpC family outer membrane porin  36.72 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2414  outer membrane protein (porin)-like protein  37.78 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200003  decreased coverage  0.00381795 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2410  outer membrane protein (porin)-like protein  37.5 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08631  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1798  outer membrane protein (porin)-like  37.5 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  37.43 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  37.43 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  37.43 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  37.43 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  37.43 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  37.43 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  37.43 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2167  OmpC family outer membrane porin  38.38 
 
 		 369 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159789  hitchhiker  0.00000436019 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  38.11 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3132  porin  31.55 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011649  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1313  OmpC family outer membrane porin  35.03 
 
 		 399 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0122268  normal  0.936999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3394  OmpC family outer membrane porin  33.87 
 
 		 383 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1119  outer membrane porin, OmpC family  34.75 
 
 		 383 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.561071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6941  outer membrane protein (porin)  34.81 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000310318  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  34.25 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  34.25 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  32.04 
 
 		 351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7242  outer membrane protein (porin)  29.71 
 
 		 372 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264722  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  32.94 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  35.6 
 
 		 363 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  35.33 
 
 		 449 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  34.74 
 
 		 363 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  34.74 
 
 		 363 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  33.97 
 
 		 355 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  33.89 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  37.2 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  34.78 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  32.13 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  33.16 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  33.16 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  35.18 
 
 		 364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  35.59 
 
 		 363 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  35.59 
 
 		 363 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  35.59 
 
 		 363 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  32.12 
 
 		 383 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  31.93 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  33.51 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  34.15 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  35.21 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  35.44 
 
 		 374 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  35.21 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  34.79 
 
 		 401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  32.98 
 
 		 359 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  30.83 
 
 		 352 aa  129  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  30.03 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4871  porin  35.56 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  35.41 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  30.03 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  35.41 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  31.72 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  32.71 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  33.42 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  35.14 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  33.33 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  32.45 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  30.56 
 
 		 357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  31.75 
 
 		 383 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  34.6 
 
 		 402 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  34.78 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  32.46 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  32.46 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  34.08 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  33.33 
 
 		 432 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  32.16 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  33.33 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>