More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0359 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0359  putative porin protein  100 
 
 		 381 aa  769    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0373439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1592  putative outer membrane protein (porin)  60.46 
 
 		 383 aa  425  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2502  putative outer membrane protein (porin)  46.93 
 
 		 376 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506227  normal  0.418434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2108  putative outer membrane protein (porin)  46.93 
 
 		 376 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  47.59 
 
 		 367 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1354  porin  44.57 
 
 		 352 aa  269  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786529 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1601  porin  32.7 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32825  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1582  porin  32.97 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  30.85 
 
 		 367 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4837  outer membrane protein, (porin)  31.34 
 
 		 374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816794 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  31.22 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  31.22 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  31.22 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  31.88 
 
 		 363 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  31.88 
 
 		 363 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  31.88 
 
 		 363 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  30.32 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1346  putative outer membrane porin  30.68 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.80313  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2036  putative outer membrane porin  30.68 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1434  putative porin protein  30.68 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1060  putative outer membrane porin  30.68 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2327  putative outer membrane porin  30.68 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3095  putative outer membrane porin  30.68 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  31.08 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  30 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  29.79 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  30.68 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  31.2 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6355  porin  28.5 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  31.2 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  30.95 
 
 		 363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  29.79 
 
 		 354 aa  113  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  28.77 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  31.71 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.09 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  29.88 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  30.82 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  30.21 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  29.79 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  31.1 
 
 		 363 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  31.1 
 
 		 363 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  29.88 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  29.88 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  30.33 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  29.27 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  29.2 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  29.73 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  28.93 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5778  porin  28.18 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  28.93 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  29.56 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  29.17 
 
 		 351 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  29.4 
 
 		 383 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3347  porin Gram-negative type  28.61 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  28.8 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3000  porin Gram-negative type  28.28 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  29.86 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  32.59 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  30.22 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  29.33 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  28.96 
 
 		 353 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4547  outer membrane porin signal peptide protein  32.92 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000157102  normal  0.308815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  29.02 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  28.71 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  29.02 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  27.34 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  29.16 
 
 		 355 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  29.16 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  28.94 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  29.27 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  28.57 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  28.04 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  28.57 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  28.69 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  27.09 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  28.27 
 
 		 396 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  28.84 
 
 		 360 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  30.48 
 
 		 335 aa  99.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  27.94 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0904  porin  29.97 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.3308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  30.06 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  29.57 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  28.96 
 
 		 355 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5504  outer membrane porin  28.77 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  26.39 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  28.13 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  27.55 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  28.15 
 
 		 404 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  28.88 
 
 		 362 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2974  outer membrane porin  28.13 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.598026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  30.65 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  28.88 
 
 		 362 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  28.88 
 
 		 362 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  30.42 
 
 		 347 aa  97.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  29.11 
 
 		 388 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  28.64 
 
 		 436 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  28.64 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  28.64 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  28.64 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  28.64 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>