More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1323 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2974  outer membrane porin  99.72 
 
 
354 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.598026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  100 
 
 
357 aa  711    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  90.76 
 
 
357 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  99.72 
 
 
354 aa  702    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  72.13 
 
 
360 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  58.59 
 
 
363 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  45.26 
 
 
376 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  45.26 
 
 
376 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  45.7 
 
 
376 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  46.5 
 
 
413 aa  279  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  46.28 
 
 
377 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  46.28 
 
 
377 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  46.28 
 
 
377 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  46.28 
 
 
377 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  46.28 
 
 
377 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  46.28 
 
 
377 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  46.28 
 
 
377 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  46.15 
 
 
378 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  46.07 
 
 
384 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  45.79 
 
 
373 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  45.79 
 
 
373 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  45.79 
 
 
373 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  46.07 
 
 
373 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  45.79 
 
 
373 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  45.79 
 
 
384 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  45.43 
 
 
379 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0029  porin  50.38 
 
 
264 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  39.68 
 
 
382 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5535  porin Gram-negative type  37.4 
 
 
391 aa  186  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.438233 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  36.16 
 
 
347 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  33.25 
 
 
357 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5539  porin  33.07 
 
 
386 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  34.38 
 
 
368 aa  166  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  35.33 
 
 
355 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  32.62 
 
 
354 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  32.62 
 
 
354 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  34.33 
 
 
355 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  33.51 
 
 
371 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  36.36 
 
 
354 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  35.04 
 
 
352 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  34.93 
 
 
355 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  34.93 
 
 
355 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2320  outer membrane protein (porin)-like  33.69 
 
 
381 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  37.09 
 
 
353 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  35.96 
 
 
365 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  35.22 
 
 
379 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1717  OmpC family outer membrane porin  34.08 
 
 
352 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  32.35 
 
 
392 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  32.35 
 
 
392 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  33.96 
 
 
401 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  32.81 
 
 
367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3347  porin Gram-negative type  32.69 
 
 
348 aa  153  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3000  porin Gram-negative type  32.69 
 
 
348 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  33 
 
 
383 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  32.9 
 
 
362 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  33.86 
 
 
374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  32.23 
 
 
389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  33.68 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  33.15 
 
 
365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  35.04 
 
 
368 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  34.25 
 
 
372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  33.68 
 
 
386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  32.99 
 
 
383 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  33.52 
 
 
363 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0350  OmpC family outer membrane porin  33.06 
 
 
372 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000145681  hitchhiker  0.00000929748 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  32.82 
 
 
368 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  33.7 
 
 
351 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  33.77 
 
 
379 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  34.66 
 
 
363 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  33.85 
 
 
402 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  34.07 
 
 
403 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  33.33 
 
 
350 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  32.51 
 
 
352 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5778  porin  31.94 
 
 
358 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  32.4 
 
 
377 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  34.09 
 
 
394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  33.15 
 
 
377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  33.08 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  32.23 
 
 
383 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  32.23 
 
 
383 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5210  outer membrane protein (porin)  35.2 
 
 
312 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00719172  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5649  outer membrane protein (porin)  35.2 
 
 
312 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  34.21 
 
 
367 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  34.75 
 
 
402 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  31.31 
 
 
385 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  32.89 
 
 
385 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5460  porin  33.33 
 
 
382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.376591 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  34.7 
 
 
403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  33.5 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0054  outer membrane protein (porin)  32.98 
 
 
382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.914863  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  34.7 
 
 
403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  31.06 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  34.7 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  41.9 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  35.55 
 
 
354 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  31.73 
 
 
383 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  31.03 
 
 
396 aa  136  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  32.99 
 
 
400 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  32.48 
 
 
386 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4912  porin  33.07 
 
 
382 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203081  normal  0.725846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>