More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3679 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3679  porin  100 
 
 		 339 aa  677    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  69.28 
 
 		 355 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  48.75 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  42.39 
 
 		 387 aa  258  9e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  44.18 
 
 		 368 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  41.34 
 
 		 400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  42.62 
 
 		 414 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  43.33 
 
 		 355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  43.44 
 
 		 385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  42.42 
 
 		 351 aa  225  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5927  porin  38.37 
 
 		 431 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  43.27 
 
 		 381 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  37.91 
 
 		 426 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  40.49 
 
 		 362 aa  215  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  39.62 
 
 		 362 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  41.29 
 
 		 344 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  41.42 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  38.61 
 
 		 348 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  39.14 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  35.79 
 
 		 374 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  36.21 
 
 		 355 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  35.57 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2014  porin  35.23 
 
 		 454 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  35.29 
 
 		 335 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5627  porin  35.12 
 
 		 372 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0464814  normal  0.0831491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3680  porin  35.67 
 
 		 366 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  34.71 
 
 		 352 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  33.06 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  32.8 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  31.61 
 
 		 358 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  31.61 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  33.86 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2423  porin  32.88 
 
 		 357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0610665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  35.67 
 
 		 335 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  33.04 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  34.8 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  31.3 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  32.35 
 
 		 361 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  30.81 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  35.44 
 
 		 359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  31.72 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  34.34 
 
 		 369 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  33.79 
 
 		 358 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  32 
 
 		 360 aa  119  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  33.88 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  32.59 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  31.43 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  34.73 
 
 		 352 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  34.73 
 
 		 352 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  31.66 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  31.53 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  32.34 
 
 		 392 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  31.47 
 
 		 354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  35.32 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  32.87 
 
 		 357 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  35.32 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  31.91 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  36.14 
 
 		 449 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  35.32 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  31.16 
 
 		 363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  35.32 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  35.32 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  30.42 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  29.62 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  29.62 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  34.08 
 
 		 356 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  32.8 
 
 		 358 aa  109  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  32.59 
 
 		 387 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  31.75 
 
 		 344 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  32.59 
 
 		 358 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  30.56 
 
 		 363 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  32.48 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  33.76 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  30.27 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  29.33 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  32.48 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  34.76 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  32.59 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  34.76 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  29.67 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  31.69 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  30.27 
 
 		 347 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  30.88 
 
 		 356 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  30.75 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  29.61 
 
 		 354 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  30.96 
 
 		 377 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  32.87 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  31.16 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  30.61 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  31.16 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  31.66 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  31.74 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  30.81 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  30.35 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  31.42 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3812  porin  33.15 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.625248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  29.46 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  31.36 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  29.92 
 
 		 355 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4894  porin  30.93 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>