More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1755 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  97.38 
 
 
344 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
344 aa  699    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  95.06 
 
 
344 aa  649    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  35.51 
 
 
370 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  32.37 
 
 
338 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  31.58 
 
 
349 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  29.12 
 
 
354 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  30.56 
 
 
335 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  28.86 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  28.86 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  28.22 
 
 
348 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  29.57 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  27.67 
 
 
346 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  33.47 
 
 
371 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  29.97 
 
 
352 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  30.92 
 
 
368 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  31.44 
 
 
374 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  29.89 
 
 
353 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  37.17 
 
 
379 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  31.21 
 
 
348 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  31.52 
 
 
339 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  30.08 
 
 
353 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  30.27 
 
 
402 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  34.07 
 
 
379 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  30.58 
 
 
374 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7660  outer membrane protein (porin)  27.15 
 
 
366 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0194748  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  29.64 
 
 
355 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  26.97 
 
 
382 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  28.34 
 
 
377 aa  99.4  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  29.35 
 
 
400 aa  99.4  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  31.43 
 
 
413 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  29.33 
 
 
351 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  28.16 
 
 
359 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  27.58 
 
 
362 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  27.4 
 
 
426 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  30.56 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  32.11 
 
 
368 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  26.7 
 
 
355 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  31.09 
 
 
381 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  31.01 
 
 
414 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  29.34 
 
 
362 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  28.57 
 
 
362 aa  96.3  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  30.28 
 
 
351 aa  96.3  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  29.63 
 
 
358 aa  96.3  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  28.19 
 
 
357 aa  95.9  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  28.22 
 
 
387 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  30.53 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  32.29 
 
 
352 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  32.29 
 
 
352 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2566  porin  31.62 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957532 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  29.64 
 
 
362 aa  94.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  27.71 
 
 
350 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  28.42 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  27.89 
 
 
366 aa  93.6  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  28.36 
 
 
383 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  27.93 
 
 
368 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  27.27 
 
 
367 aa  93.2  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  35.03 
 
 
401 aa  93.2  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  30.86 
 
 
389 aa  92.4  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  32.09 
 
 
379 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  32.29 
 
 
314 aa  92.8  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  30.51 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  30.7 
 
 
316 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  27.1 
 
 
352 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  26.9 
 
 
367 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  29 
 
 
368 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5539  porin  31.33 
 
 
386 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  32.26 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  29.75 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  27.71 
 
 
362 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4878  porin  28.09 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311549  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  32.26 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  34.78 
 
 
430 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  28.25 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  27.55 
 
 
355 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  30.26 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  26.75 
 
 
344 aa  90.5  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  29.63 
 
 
363 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  29.63 
 
 
363 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  29.63 
 
 
449 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  27.83 
 
 
356 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  26.09 
 
 
361 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  29.63 
 
 
363 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  28.19 
 
 
313 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  29.63 
 
 
363 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  29.63 
 
 
363 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  34.24 
 
 
430 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  34.24 
 
 
430 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  31.95 
 
 
361 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  28.19 
 
 
314 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  37.18 
 
 
390 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  36.02 
 
 
430 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  31.1 
 
 
383 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  32.8 
 
 
380 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  36.02 
 
 
430 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  32.87 
 
 
387 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  30.71 
 
 
383 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  36.02 
 
 
430 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  31.1 
 
 
383 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1313  OmpC family outer membrane porin  27.06 
 
 
399 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0122268  normal  0.936999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>