More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2014 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2014  porin  100 
 
 		 454 aa  902    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  46.92 
 
 		 426 aa  326  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5927  porin  45.15 
 
 		 431 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  44.84 
 
 		 400 aa  293  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  45.41 
 
 		 385 aa  292  7e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  44.93 
 
 		 414 aa  287  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  42.31 
 
 		 387 aa  269  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  44.39 
 
 		 381 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  40.27 
 
 		 349 aa  206  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  39.84 
 
 		 368 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  38.51 
 
 		 348 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  36.29 
 
 		 362 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  34.88 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  36.29 
 
 		 348 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  35.17 
 
 		 355 aa  159  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  35.82 
 
 		 355 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  33.33 
 
 		 362 aa  156  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  32.66 
 
 		 344 aa  154  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3680  porin  34.09 
 
 		 366 aa  153  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  34.97 
 
 		 351 aa  153  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  34.36 
 
 		 375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  31.77 
 
 		 355 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  33.42 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  33.99 
 
 		 358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5627  porin  33.7 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0464814  normal  0.0831491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2423  porin  33.89 
 
 		 357 aa  109  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0610665 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  30.43 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  30.12 
 
 		 335 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  33.43 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  31.36 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  31.5 
 
 		 352 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  31.5 
 
 		 352 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  33.33 
 
 		 354 aa  93.2  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  31.07 
 
 		 344 aa  90.9  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  28.21 
 
 		 360 aa  90.5  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  31.74 
 
 		 369 aa  89.7  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  30.6 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  30.6 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  30.49 
 
 		 350 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  30.33 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  32.19 
 
 		 363 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  30.29 
 
 		 358 aa  87.4  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  32.19 
 
 		 363 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  32.19 
 
 		 363 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  32.19 
 
 		 363 aa  87  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  32.19 
 
 		 363 aa  87  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  30.66 
 
 		 350 aa  86.7  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  29.68 
 
 		 351 aa  86.7  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  31.13 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  31.89 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  29.72 
 
 		 363 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.59 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  29.05 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  31.82 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  29.18 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  32.61 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  32.16 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  30.49 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  30.31 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  31.52 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  29.18 
 
 		 344 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  29.12 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  29.68 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  40.15 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  29.21 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0904  porin  30.08 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.3308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  29.84 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  30.77 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  29.21 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  28.33 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  27.55 
 
 		 359 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  30.92 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  27.12 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  27.71 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  30.75 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  32.82 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  25.91 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  30.65 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  29.01 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  31.61 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  28.8 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  29.61 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  30.75 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  30.75 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  30.45 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  32.27 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  28.41 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  30.35 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  29.43 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  30.35 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  29.48 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  30.35 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  29.43 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  30.7 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2544  porin  30.33 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644529 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  26.16 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  27.45 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  28.93 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  24.72 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  28.01 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>