More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1084 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  100 
 
 		 370 aa  740    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  37.76 
 
 		 374 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  37.07 
 
 		 338 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  38.29 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  36.36 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  35.51 
 
 		 344 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  34.36 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  34.94 
 
 		 344 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  36.13 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  33.96 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  37.81 
 
 		 347 aa  155  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  33.61 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  33.61 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  34.7 
 
 		 362 aa  149  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  33.16 
 
 		 348 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  33.79 
 
 		 348 aa  146  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  34.15 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  31.78 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  31.39 
 
 		 436 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  31.39 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  31.39 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  31.39 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  31.39 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  31.39 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  31.05 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  31.14 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  34.2 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  34.39 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  33.51 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  32.02 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  31.34 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  30.81 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  30.81 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  32.63 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  31.14 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  33.42 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  34.27 
 
 		 385 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  34.97 
 
 		 335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  34.55 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  31.96 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  32.15 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  33.17 
 
 		 384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  34.52 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  32.15 
 
 		 383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  35.34 
 
 		 359 aa  133  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  32.03 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  32.83 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  34.65 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  34.42 
 
 		 368 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  31.85 
 
 		 392 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  33.06 
 
 		 357 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  31.85 
 
 		 392 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  32.8 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  34.16 
 
 		 388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  31.85 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  33.33 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  31.99 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  31.49 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  36.49 
 
 		 380 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3218  porin  31.94 
 
 		 373 aa  126  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.819696  normal  0.0778047 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  35.65 
 
 		 380 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  32.45 
 
 		 344 aa  125  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  29.7 
 
 		 360 aa  125  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  31.84 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  31.84 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  31.84 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  32.58 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  36.21 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  31.84 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  35.65 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  35.75 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5460  porin  32.09 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.376591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4912  porin  32.09 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203081  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5632  porin  31.66 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0304788  decreased coverage  0.00129343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5227  porin  31.66 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  30 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4597  porin  31.66 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000189593 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  31.58 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  30.34 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  33.09 
 
 		 384 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  31.83 
 
 		 386 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  30.29 
 
 		 368 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  32.75 
 
 		 387 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0054  outer membrane protein (porin)  30.97 
 
 		 382 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.914863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  35.18 
 
 		 380 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  32.33 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  41.55 
 
 		 394 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  42.29 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  41.1 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  32.22 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  30.85 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  32.36 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  31.04 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  30.07 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  31.57 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  29.12 
 
 		 396 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.19 
 
 		 389 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  34.78 
 
 		 344 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  31.94 
 
 		 414 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  31.84 
 
 		 389 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>