More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5954 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5954  porin  100 
 
 		 327 aa  668    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  68.84 
 
 		 336 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  69.44 
 
 		 336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  61.19 
 
 		 329 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  50.14 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0130  outer membrane porin protein  44.92 
 
 		 326 aa  221  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  0.0261696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  32.63 
 
 		 359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  34.31 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  31.72 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  31.09 
 
 		 348 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  33.6 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  32.8 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  33.44 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  30 
 
 		 371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  32.01 
 
 		 352 aa  116  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  31.3 
 
 		 339 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  29.52 
 
 		 374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  28.97 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  32.16 
 
 		 362 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  31.22 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  32.1 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  30.32 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  31.69 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  31.69 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  33.15 
 
 		 335 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  31.14 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  32.04 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  34.36 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  30 
 
 		 389 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  28.25 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  31.44 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  30.4 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  27.54 
 
 		 400 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  29.53 
 
 		 384 aa  99.8  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  33.53 
 
 		 354 aa  99.4  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  27.91 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  27.12 
 
 		 370 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  30.23 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  30.69 
 
 		 389 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  30.95 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  26.85 
 
 		 426 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  36.53 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  30.2 
 
 		 369 aa  96.3  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  30.48 
 
 		 355 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  30.48 
 
 		 355 aa  96.3  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  33.04 
 
 		 367 aa  95.9  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  30.19 
 
 		 354 aa  95.9  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  28.88 
 
 		 349 aa  95.9  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  31.16 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  32.37 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  27.71 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  27.14 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  39.13 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  30.06 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  25.87 
 
 		 376 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  30.06 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  30.26 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  31.13 
 
 		 351 aa  93.6  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2990  porin  30.98 
 
 		 387 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0177619  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  36.04 
 
 		 384 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  36.04 
 
 		 384 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  36.04 
 
 		 384 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1245  porin  29.07 
 
 		 342 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240847  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  41.84 
 
 		 365 aa  92.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  32.67 
 
 		 383 aa  92.4  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1599  putative outer membrane porin signal peptide protein  28.46 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  36.32 
 
 		 384 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  29.3 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  30.26 
 
 		 436 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  36.04 
 
 		 384 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5288  outer membrane porin  31.7 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  36.62 
 
 		 436 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  36.04 
 
 		 384 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  31.91 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  30.16 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  31.32 
 
 		 384 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  29.62 
 
 		 413 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  29.05 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  30.35 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  30.35 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  31.61 
 
 		 362 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  28.77 
 
 		 387 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  30.35 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  30.35 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  30.35 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  31.61 
 
 		 362 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  31.61 
 
 		 362 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  31.2 
 
 		 374 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  29.38 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  28.77 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  29.88 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  30.35 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  28.91 
 
 		 382 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  29.33 
 
 		 389 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  30.28 
 
 		 384 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  35.59 
 
 		 384 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  29.82 
 
 		 357 aa  90.1  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  28.77 
 
 		 358 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  30.46 
 
 		 384 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  30.46 
 
 		 384 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>