More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4343 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4343  porin  100 
 
 		 329 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  65.68 
 
 		 336 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  65.09 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  61.19 
 
 		 327 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  51.14 
 
 		 340 aa  309  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0130  outer membrane porin protein  44.48 
 
 		 326 aa  215  9e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  0.0261696 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  30.46 
 
 		 371 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  32.25 
 
 		 366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  33.14 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  32.59 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  31.07 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  33.42 
 
 		 374 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  33.33 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  32.08 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  33.62 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  34.17 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  33.24 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  30.17 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  30.11 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  30.77 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  34.41 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  32.55 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  32.8 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  30.41 
 
 		 382 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  29.11 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  30.9 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  29.5 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  29.84 
 
 		 376 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  32.53 
 
 		 384 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  31.18 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  32.53 
 
 		 384 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  32.53 
 
 		 384 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  32.53 
 
 		 384 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  32.53 
 
 		 384 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  32.42 
 
 		 394 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  32.53 
 
 		 384 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  32.4 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  32.53 
 
 		 384 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  31.61 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  32.53 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  31.78 
 
 		 392 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  31.88 
 
 		 372 aa  102  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  31.78 
 
 		 392 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  32.58 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  36 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5190  outer membrane porin  30.03 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.353922 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  30.58 
 
 		 394 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  32.68 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  32.58 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  32.58 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  32.58 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  31.94 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  31.81 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  31.09 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  30.35 
 
 		 355 aa  99.4  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  32.19 
 
 		 358 aa  99.4  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  31.09 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  30.95 
 
 		 383 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  30.13 
 
 		 384 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2492  outer membrane protein (porin)  29.89 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  31.09 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  38.6 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  30.75 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  31.12 
 
 		 383 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  31.23 
 
 		 387 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  31.09 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  31.76 
 
 		 355 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  29.87 
 
 		 393 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  30.83 
 
 		 376 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  30.83 
 
 		 376 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  31.09 
 
 		 374 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  30.83 
 
 		 376 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  30.83 
 
 		 376 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3347  porin Gram-negative type  30.88 
 
 		 348 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  32.06 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  33.33 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2566  porin  31.53 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  33.67 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  31.05 
 
 		 413 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  33.09 
 
 		 363 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3897  porin  29.91 
 
 		 372 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239452 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  32.53 
 
 		 384 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  35.19 
 
 		 357 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  31.37 
 
 		 363 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  32.32 
 
 		 355 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  32.32 
 
 		 355 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  32.14 
 
 		 381 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  28.73 
 
 		 346 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  31.44 
 
 		 384 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  32.32 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  31.44 
 
 		 384 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  31.44 
 
 		 384 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  30.21 
 
 		 371 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  30.66 
 
 		 384 aa  93.6  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  33.73 
 
 		 369 aa  93.2  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  31.16 
 
 		 354 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  29.2 
 
 		 393 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  30.05 
 
 		 471 aa  92.8  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2314  porin  29.6 
 
 		 350 aa  92.4  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  29.31 
 
 		 372 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>