More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1245 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1245  porin  100 
 
 		 342 aa  692    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  45.22 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  32.35 
 
 		 350 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0130  outer membrane porin protein  31.98 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  0.0261696 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  31.98 
 
 		 413 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  29.41 
 
 		 369 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  30.37 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  28.22 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  29.8 
 
 		 336 aa  99.8  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  30.36 
 
 		 357 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  30.36 
 
 		 357 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  28.12 
 
 		 360 aa  96.7  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  32.04 
 
 		 376 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  30.64 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  29.15 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  29.02 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  29.36 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  30.4 
 
 		 388 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  30.46 
 
 		 358 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  31.82 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  31.45 
 
 		 358 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  32.35 
 
 		 340 aa  92.4  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  30.28 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  30.28 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2492  outer membrane protein (porin)  30.5 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  30.28 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  29.78 
 
 		 335 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  30.63 
 
 		 372 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3897  porin  31.21 
 
 		 372 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  26.85 
 
 		 359 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  28.24 
 
 		 361 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  28.85 
 
 		 344 aa  89.7  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  30.84 
 
 		 376 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  29.91 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.69 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  29.26 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  30.13 
 
 		 363 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  28.53 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5070  porin  30.35 
 
 		 372 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.189644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  28.42 
 
 		 367 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  28.72 
 
 		 349 aa  86.3  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  29.62 
 
 		 372 aa  86.3  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4871  porin  29.51 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0333  outer membrane porin, putative  30.72 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277065  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  29.11 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  28.18 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  28.03 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  29.01 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  31.25 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  28.79 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  27.09 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6034  porin  34.25 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  30.75 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  27.86 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  28.84 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  28.98 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  28.02 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  36.76 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  34.88 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  29.62 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  29.62 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  26.9 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  31.64 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  29.62 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  29.43 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  29.06 
 
 		 344 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  29.19 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  29.57 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  29.86 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  29.19 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  31.21 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  31.21 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  29.86 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  29.49 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  29.09 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  34.02 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  30.72 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  30.14 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  29.67 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  33.47 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  28.57 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  31.52 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  35.35 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  29.09 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  34.88 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  34.88 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  34.88 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  28.61 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  34.88 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  28.99 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7660  outer membrane protein (porin)  29.56 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0194748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  35.6 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  34.48 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  28.86 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  34.58 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2717  OmpC family outer membrane porin  34.5 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000457721  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  27.34 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  28.81 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  29.53 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  27.22 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>