More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1564 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  94.4 
 
 		 357 aa  671    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  100 
 
 		 357 aa  713    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  100 
 
 		 357 aa  713    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  83.47 
 
 		 357 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  83.47 
 
 		 357 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  50.58 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  52.73 
 
 		 340 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  40.06 
 
 		 357 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  39.76 
 
 		 357 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  40.3 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  39.7 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  40.24 
 
 		 341 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  40.06 
 
 		 351 aa  202  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  39.76 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  39.76 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  38.95 
 
 		 363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  37.46 
 
 		 361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  38.65 
 
 		 340 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  39.27 
 
 		 362 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  38.77 
 
 		 342 aa  192  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  37.72 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  35.51 
 
 		 367 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  37.76 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  38.24 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  38.21 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  37.09 
 
 		 361 aa  186  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  38.51 
 
 		 387 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  40.88 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  37.91 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  36.83 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  35.82 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  37.09 
 
 		 361 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  35.99 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  36.72 
 
 		 358 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  36.72 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  36.72 
 
 		 358 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  36.72 
 
 		 358 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  36.72 
 
 		 358 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  36.42 
 
 		 358 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  36.12 
 
 		 358 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  34.71 
 
 		 360 aa  176  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  32.68 
 
 		 338 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  34.3 
 
 		 523 aa  113  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  32.96 
 
 		 350 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  33.71 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  34.32 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  34.32 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  34.05 
 
 		 350 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  33.63 
 
 		 430 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  29.73 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  33.63 
 
 		 430 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  30.55 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  33.63 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  33.33 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  33.33 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  30.43 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  33.33 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  33.33 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  30.93 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  29.88 
 
 		 335 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  29.55 
 
 		 344 aa  99.4  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  33.24 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  33.24 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  32.05 
 
 		 390 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  32.07 
 
 		 374 aa  97.4  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  33.24 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  31.09 
 
 		 386 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  31.34 
 
 		 362 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  29.87 
 
 		 360 aa  96.7  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  33.43 
 
 		 394 aa  96.3  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  29.81 
 
 		 376 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  29.81 
 
 		 376 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  33.33 
 
 		 363 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  33.33 
 
 		 449 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  27.53 
 
 		 384 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  33.33 
 
 		 363 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  30.21 
 
 		 436 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  33.33 
 
 		 363 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  31.88 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  33.33 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  33.33 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  29.81 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  32.05 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2720  OmpC family outer membrane porin  27.87 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  29.25 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  30 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6483  porin  31.15 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  33.33 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6718  porin  31.15 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.457172 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  29.77 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  30 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  29.29 
 
 		 436 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  28.43 
 
 		 348 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  29.11 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  30.71 
 
 		 385 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  30.36 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  30.36 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  30.36 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  29.53 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  30.36 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>